Protein–RNA interactions for Protein: P07858

CTSB, Cathepsin B, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSBP07858 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CTSBP07858 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CTSBP07858 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CTSBP07858 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CTSBP07858 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CTSBP07858 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CTSBP07858 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTSBP07858 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CTSBP07858 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTSBP07858 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CTSBP07858 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTSBP07858 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CTSBP07858 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTSBP07858 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTSBP07858 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTSBP07858 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CTSBP07858 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTSBP07858 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTSBP07858 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTSBP07858 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTSBP07858 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTSBP07858 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTSBP07858 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTSBP07858 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTSBP07858 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTSBP07858 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTSBP07858 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTSBP07858 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTSBP07858 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CTSBP07858 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CTSBP07858 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CTSBP07858 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTSBP07858 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTSBP07858 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CTSBP07858 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CTSBP07858 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CTSBP07858 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CTSBP07858 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTSBP07858 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CTSBP07858 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CTSBP07858 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CTSBP07858 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTSBP07858 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTSBP07858 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CTSBP07858 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CTSBP07858 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CTSBP07858 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTSBP07858 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CTSBP07858 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CTSBP07858 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTSBP07858 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTSBP07858 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTSBP07858 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTSBP07858 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CTSBP07858 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTSBP07858 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTSBP07858 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTSBP07858 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CTSBP07858 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CTSBP07858 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTSBP07858 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTSBP07858 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CTSBP07858 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CTSBP07858 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTSBP07858 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CTSBP07858 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CTSBP07858 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTSBP07858 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CTSBP07858 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTSBP07858 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CTSBP07858 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTSBP07858 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CTSBP07858 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CTSBP07858 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CTSBP07858 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTSBP07858 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CTSBP07858 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CTSBP07858 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTSBP07858 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CTSBP07858 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTSBP07858 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CTSBP07858 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CTSBP07858 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTSBP07858 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTSBP07858 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CTSBP07858 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTSBP07858 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTSBP07858 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CTSBP07858 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTSBP07858 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTSBP07858 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CTSBP07858 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTSBP07858 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTSBP07858 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTSBP07858 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CTSBP07858 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSBP07858 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSBP07858 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CTSBP07858 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CTSBP07858 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms