Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGAVP06756 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGAVP06756 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
ITGAVP06756 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGAVP06756 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGAVP06756 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
ITGAVP06756 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGAVP06756 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ITGAVP06756 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGAVP06756 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
ITGAVP06756 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGAVP06756 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
ITGAVP06756 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
ITGAVP06756 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
ITGAVP06756 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
ITGAVP06756 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
ITGAVP06756 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGAVP06756 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ITGAVP06756 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGAVP06756 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
ITGAVP06756 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAVP06756 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAVP06756 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAVP06756 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ITGAVP06756 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
ITGAVP06756 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ITGAVP06756 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ITGAVP06756 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ITGAVP06756 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGAVP06756 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ITGAVP06756 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ITGAVP06756 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ITGAVP06756 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ITGAVP06756 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGAVP06756 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ITGAVP06756 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAVP06756 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAVP06756 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAVP06756 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ITGAVP06756 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAVP06756 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAVP06756 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAVP06756 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ITGAVP06756 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ITGAVP06756 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ITGAVP06756 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGAVP06756 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGAVP06756 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ITGAVP06756 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAVP06756 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAVP06756 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAVP06756 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ITGAVP06756 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAVP06756 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ITGAVP06756 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGAVP06756 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGAVP06756 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ITGAVP06756 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGAVP06756 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGAVP06756 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ITGAVP06756 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ITGAVP06756 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGAVP06756 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGAVP06756 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGAVP06756 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ITGAVP06756 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGAVP06756 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ITGAVP06756 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGAVP06756 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGAVP06756 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGAVP06756 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ITGAVP06756 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ITGAVP06756 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ITGAVP06756 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGAVP06756 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGAVP06756 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ITGAVP06756 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGAVP06756 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ITGAVP06756 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ITGAVP06756 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGAVP06756 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ITGAVP06756 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ITGAVP06756 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ITGAVP06756 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAVP06756 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ITGAVP06756 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGAVP06756 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ITGAVP06756 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ITGAVP06756 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGAVP06756 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ITGAVP06756 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ITGAVP06756 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGAVP06756 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ITGAVP06756 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGAVP06756 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGAVP06756 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ITGAVP06756 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGAVP06756 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ITGAVP06756 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ITGAVP06756 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms