Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
POLBP06746 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLBP06746 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLBP06746 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
POLBP06746 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
POLBP06746 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLBP06746 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
POLBP06746 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLBP06746 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
POLBP06746 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
POLBP06746 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLBP06746 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLBP06746 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLBP06746 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
POLBP06746 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLBP06746 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLBP06746 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLBP06746 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLBP06746 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLBP06746 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLBP06746 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLBP06746 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLBP06746 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLBP06746 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLBP06746 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
POLBP06746 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
POLBP06746 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLBP06746 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLBP06746 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
POLBP06746 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLBP06746 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLBP06746 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
POLBP06746 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
POLBP06746 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLBP06746 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
POLBP06746 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
POLBP06746 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLBP06746 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
POLBP06746 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
POLBP06746 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
POLBP06746 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
POLBP06746 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLBP06746 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLBP06746 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
POLBP06746 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLBP06746 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
POLBP06746 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLBP06746 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
POLBP06746 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
POLBP06746 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
POLBP06746 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLBP06746 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
POLBP06746 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
POLBP06746 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
POLBP06746 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
POLBP06746 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
POLBP06746 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
POLBP06746 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
POLBP06746 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLBP06746 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
POLBP06746 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLBP06746 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLBP06746 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
POLBP06746 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLBP06746 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLBP06746 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLBP06746 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
POLBP06746 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLBP06746 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLBP06746 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
POLBP06746 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLBP06746 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
POLBP06746 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
POLBP06746 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
POLBP06746 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLBP06746 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
POLBP06746 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLBP06746 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
POLBP06746 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLBP06746 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
POLBP06746 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLBP06746 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
POLBP06746 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
POLBP06746 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
POLBP06746 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLBP06746 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
POLBP06746 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
POLBP06746 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLBP06746 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
POLBP06746 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
POLBP06746 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
POLBP06746 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
POLBP06746 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
POLBP06746 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLBP06746 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
POLBP06746 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
POLBP06746 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
POLBP06746 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
POLBP06746 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
POLBP06746 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.1 ms