Protein–RNA interactions for Protein: P06132

UROD, Uroporphyrinogen decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URODP06132 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
URODP06132 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
URODP06132 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
URODP06132 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
URODP06132 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
URODP06132 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
URODP06132 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
URODP06132 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
URODP06132 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
URODP06132 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
URODP06132 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
URODP06132 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
URODP06132 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
URODP06132 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
URODP06132 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
URODP06132 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
URODP06132 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
URODP06132 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
URODP06132 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
URODP06132 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
URODP06132 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
URODP06132 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
URODP06132 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
URODP06132 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
URODP06132 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
URODP06132 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
URODP06132 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
URODP06132 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
URODP06132 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
URODP06132 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
URODP06132 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
URODP06132 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
URODP06132 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
URODP06132 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
URODP06132 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
URODP06132 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
URODP06132 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
URODP06132 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
URODP06132 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
URODP06132 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
URODP06132 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
URODP06132 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
URODP06132 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
URODP06132 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
URODP06132 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
URODP06132 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
URODP06132 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
URODP06132 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
URODP06132 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
URODP06132 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
URODP06132 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
URODP06132 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
URODP06132 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
URODP06132 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
URODP06132 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
URODP06132 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
URODP06132 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
URODP06132 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
URODP06132 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
URODP06132 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
URODP06132 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
URODP06132 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
URODP06132 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
URODP06132 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
URODP06132 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
URODP06132 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
URODP06132 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
URODP06132 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
URODP06132 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
URODP06132 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
URODP06132 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
URODP06132 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
URODP06132 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
URODP06132 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
URODP06132 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
URODP06132 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
URODP06132 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
URODP06132 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
URODP06132 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
URODP06132 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
URODP06132 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
URODP06132 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
URODP06132 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
URODP06132 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
URODP06132 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
URODP06132 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
URODP06132 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
URODP06132 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
URODP06132 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
URODP06132 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
URODP06132 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
URODP06132 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
URODP06132 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
URODP06132 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
URODP06132 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
URODP06132 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
URODP06132 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
URODP06132 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
URODP06132 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
URODP06132 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms