Protein–RNA interactions for Protein: P04430

IGKV1-16, Immunoglobulin kappa variable 1-16, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-16P04430 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
IGKV1-16P04430 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV1-16P04430 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV1-16P04430 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
IGKV1-16P04430 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV1-16P04430 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV1-16P04430 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV1-16P04430 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
IGKV1-16P04430 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV1-16P04430 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
IGKV1-16P04430 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGKV1-16P04430 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
IGKV1-16P04430 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGKV1-16P04430 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGKV1-16P04430 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
IGKV1-16P04430 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
IGKV1-16P04430 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGKV1-16P04430 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
IGKV1-16P04430 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
IGKV1-16P04430 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV1-16P04430 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGKV1-16P04430 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGKV1-16P04430 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGKV1-16P04430 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGKV1-16P04430 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV1-16P04430 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV1-16P04430 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV1-16P04430 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGKV1-16P04430 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV1-16P04430 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
IGKV1-16P04430 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV1-16P04430 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IGKV1-16P04430 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV1-16P04430 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGKV1-16P04430 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGKV1-16P04430 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV1-16P04430 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IGKV1-16P04430 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV1-16P04430 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGKV1-16P04430 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV1-16P04430 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGKV1-16P04430 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV1-16P04430 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGKV1-16P04430 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV1-16P04430 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV1-16P04430 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV1-16P04430 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGKV1-16P04430 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGKV1-16P04430 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IGKV1-16P04430 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGKV1-16P04430 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IGKV1-16P04430 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
IGKV1-16P04430 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IGKV1-16P04430 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
IGKV1-16P04430 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV1-16P04430 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGKV1-16P04430 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGKV1-16P04430 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGKV1-16P04430 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGKV1-16P04430 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV1-16P04430 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV1-16P04430 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGKV1-16P04430 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV1-16P04430 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV1-16P04430 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV1-16P04430 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV1-16P04430 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV1-16P04430 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGKV1-16P04430 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV1-16P04430 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGKV1-16P04430 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV1-16P04430 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV1-16P04430 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV1-16P04430 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGKV1-16P04430 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGKV1-16P04430 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGKV1-16P04430 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV1-16P04430 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGKV1-16P04430 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGKV1-16P04430 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV1-16P04430 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGKV1-16P04430 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1-16P04430 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1-16P04430 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1-16P04430 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1-16P04430 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1-16P04430 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1-16P04430 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1-16P04430 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1-16P04430 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IGKV1-16P04430 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV1-16P04430 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV1-16P04430 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGKV1-16P04430 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGKV1-16P04430 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV1-16P04430 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGKV1-16P04430 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGKV1-16P04430 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGKV1-16P04430 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGKV1-16P04430 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms