Protein–RNA interactions for Protein: P02730

SLC4A1, Band 3 anion transport protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A1P02730 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A1P02730 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SLC4A1P02730 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A1P02730 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SLC4A1P02730 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SLC4A1P02730 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A1P02730 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC4A1P02730 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A1P02730 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A1P02730 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SLC4A1P02730 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A1P02730 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC4A1P02730 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SLC4A1P02730 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SLC4A1P02730 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A1P02730 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A1P02730 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A1P02730 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SLC4A1P02730 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SLC4A1P02730 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A1P02730 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A1P02730 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SLC4A1P02730 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A1P02730 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SLC4A1P02730 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC4A1P02730 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A1P02730 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SLC4A1P02730 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A1P02730 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A1P02730 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC4A1P02730 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A1P02730 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC4A1P02730 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A1P02730 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A1P02730 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC4A1P02730 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC4A1P02730 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC4A1P02730 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC4A1P02730 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC4A1P02730 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC4A1P02730 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SLC4A1P02730 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A1P02730 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC4A1P02730 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC4A1P02730 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC4A1P02730 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC4A1P02730 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A1P02730 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A1P02730 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC4A1P02730 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC4A1P02730 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A1P02730 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC4A1P02730 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A1P02730 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC4A1P02730 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A1P02730 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A1P02730 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC4A1P02730 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC4A1P02730 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A1P02730 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC4A1P02730 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC4A1P02730 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC4A1P02730 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC4A1P02730 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A1P02730 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A1P02730 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A1P02730 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A1P02730 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A1P02730 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A1P02730 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC4A1P02730 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC4A1P02730 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A1P02730 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC4A1P02730 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A1P02730 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A1P02730 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A1P02730 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC4A1P02730 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A1P02730 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC4A1P02730 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A1P02730 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A1P02730 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A1P02730 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC4A1P02730 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A1P02730 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC4A1P02730 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A1P02730 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A1P02730 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A1P02730 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC4A1P02730 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A1P02730 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC4A1P02730 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC4A1P02730 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A1P02730 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A1P02730 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC4A1P02730 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC4A1P02730 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC4A1P02730 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC4A1P02730 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC4A1P02730 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms