Protein–RNA interactions for Protein: P01772

IGHV3-33, Immunoglobulin heavy variable 3-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-33P01772 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
IGHV3-33P01772 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
IGHV3-33P01772 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
IGHV3-33P01772 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IGHV3-33P01772 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IGHV3-33P01772 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
IGHV3-33P01772 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
IGHV3-33P01772 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
IGHV3-33P01772 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IGHV3-33P01772 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
IGHV3-33P01772 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IGHV3-33P01772 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
IGHV3-33P01772 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
IGHV3-33P01772 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
IGHV3-33P01772 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IGHV3-33P01772 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
IGHV3-33P01772 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGHV3-33P01772 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
IGHV3-33P01772 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGHV3-33P01772 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGHV3-33P01772 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGHV3-33P01772 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
IGHV3-33P01772 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
IGHV3-33P01772 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGHV3-33P01772 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGHV3-33P01772 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
IGHV3-33P01772 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGHV3-33P01772 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGHV3-33P01772 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
IGHV3-33P01772 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGHV3-33P01772 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGHV3-33P01772 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IGHV3-33P01772 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IGHV3-33P01772 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IGHV3-33P01772 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IGHV3-33P01772 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IGHV3-33P01772 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IGHV3-33P01772 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IGHV3-33P01772 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
IGHV3-33P01772 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IGHV3-33P01772 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
IGHV3-33P01772 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGHV3-33P01772 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGHV3-33P01772 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
IGHV3-33P01772 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGHV3-33P01772 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGHV3-33P01772 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
IGHV3-33P01772 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGHV3-33P01772 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGHV3-33P01772 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGHV3-33P01772 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGHV3-33P01772 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
IGHV3-33P01772 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGHV3-33P01772 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGHV3-33P01772 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGHV3-33P01772 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
IGHV3-33P01772 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGHV3-33P01772 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
IGHV3-33P01772 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
IGHV3-33P01772 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
IGHV3-33P01772 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IGHV3-33P01772 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
IGHV3-33P01772 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGHV3-33P01772 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGHV3-33P01772 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
IGHV3-33P01772 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
IGHV3-33P01772 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
IGHV3-33P01772 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
IGHV3-33P01772 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGHV3-33P01772 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGHV3-33P01772 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGHV3-33P01772 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGHV3-33P01772 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
IGHV3-33P01772 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
IGHV3-33P01772 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGHV3-33P01772 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
IGHV3-33P01772 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IGHV3-33P01772 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
IGHV3-33P01772 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
IGHV3-33P01772 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGHV3-33P01772 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGHV3-33P01772 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
IGHV3-33P01772 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGHV3-33P01772 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
IGHV3-33P01772 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGHV3-33P01772 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
IGHV3-33P01772 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
IGHV3-33P01772 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
IGHV3-33P01772 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGHV3-33P01772 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGHV3-33P01772 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
IGHV3-33P01772 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
IGHV3-33P01772 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGHV3-33P01772 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGHV3-33P01772 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGHV3-33P01772 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
IGHV3-33P01772 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGHV3-33P01772 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGHV3-33P01772 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
IGHV3-33P01772 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms