Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
F9P00740 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
F9P00740 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
F9P00740 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
F9P00740 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
F9P00740 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
F9P00740 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
F9P00740 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
F9P00740 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
F9P00740 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
F9P00740 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
F9P00740 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
F9P00740 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
F9P00740 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
F9P00740 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
F9P00740 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
F9P00740 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
F9P00740 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
F9P00740 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
F9P00740 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
F9P00740 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
F9P00740 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
F9P00740 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
F9P00740 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
F9P00740 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
F9P00740 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
F9P00740 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
F9P00740 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
F9P00740 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
F9P00740 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
F9P00740 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
F9P00740 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
F9P00740 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
F9P00740 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
F9P00740 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
F9P00740 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
F9P00740 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
F9P00740 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
F9P00740 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
F9P00740 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
F9P00740 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
F9P00740 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
F9P00740 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
F9P00740 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
F9P00740 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
F9P00740 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
F9P00740 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
F9P00740 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
F9P00740 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
F9P00740 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
F9P00740 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
F9P00740 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
F9P00740 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
F9P00740 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
F9P00740 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
F9P00740 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
F9P00740 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
F9P00740 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
F9P00740 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
F9P00740 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
F9P00740 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
F9P00740 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
F9P00740 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
F9P00740 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
F9P00740 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
F9P00740 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
F9P00740 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
F9P00740 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
F9P00740 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
F9P00740 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
F9P00740 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
F9P00740 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
F9P00740 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
F9P00740 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
F9P00740 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
F9P00740 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
F9P00740 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
F9P00740 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
F9P00740 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
F9P00740 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
F9P00740 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
F9P00740 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
F9P00740 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
F9P00740 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
F9P00740 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
F9P00740 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
F9P00740 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
F9P00740 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
F9P00740 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
F9P00740 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
F9P00740 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
F9P00740 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
F9P00740 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
F9P00740 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
F9P00740 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
F9P00740 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
F9P00740 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
F9P00740 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
F9P00740 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
F9P00740 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms