Protein–RNA interactions for Protein: O94964

SOGA1, Protein SOGA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA1O94964 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
SOGA1O94964 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
SOGA1O94964 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC48.07■■■■■ 5.29
SOGA1O94964 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.28
SOGA1O94964 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC48.07■■■■■ 5.28
SOGA1O94964 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
SOGA1O94964 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
SOGA1O94964 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
SOGA1O94964 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.98■■■■■ 5.27
SOGA1O94964 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.96■■■■■ 5.27
SOGA1O94964 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC47.95■■■■■ 5.27
SOGA1O94964 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.95■■■■■ 5.27
SOGA1O94964 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.94■■■■■ 5.26
SOGA1O94964 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.86■■■■■ 5.25
SOGA1O94964 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.85■■■■■ 5.25
SOGA1O94964 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
SOGA1O94964 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC47.83■■■■■ 5.25
SOGA1O94964 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC47.81■■■■■ 5.24
SOGA1O94964 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC47.81■■■■■ 5.24
SOGA1O94964 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC47.8■■■■■ 5.24
SOGA1O94964 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC47.79■■■■■ 5.24
SOGA1O94964 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC47.78■■■■■ 5.24
SOGA1O94964 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC47.76■■■■■ 5.24
SOGA1O94964 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
SOGA1O94964 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC47.74■■■■■ 5.23
SOGA1O94964 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC47.74■■■■■ 5.23
SOGA1O94964 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
SOGA1O94964 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
SOGA1O94964 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.71■■■■■ 5.23
SOGA1O94964 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
SOGA1O94964 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC47.69■■■■■ 5.22
SOGA1O94964 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC47.67■■■■■ 5.22
SOGA1O94964 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.66■■■■■ 5.22
SOGA1O94964 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC47.64■■■■■ 5.22
SOGA1O94964 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC47.62■■■■■ 5.21
SOGA1O94964 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.62■■■■■ 5.21
SOGA1O94964 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC47.61■■■■■ 5.21
SOGA1O94964 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
SOGA1O94964 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.59■■■■■ 5.21
SOGA1O94964 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
SOGA1O94964 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.58■■■■■ 5.21
SOGA1O94964 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.56■■■■■ 5.2
SOGA1O94964 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC47.56■■■■■ 5.2
SOGA1O94964 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
SOGA1O94964 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
SOGA1O94964 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.19
SOGA1O94964 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC47.44■■■■■ 5.18
SOGA1O94964 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC47.43■■■■■ 5.18
SOGA1O94964 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC47.41■■■■■ 5.18
SOGA1O94964 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
SOGA1O94964 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
SOGA1O94964 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC47.39■■■■■ 5.18
SOGA1O94964 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
SOGA1O94964 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.39■■■■■ 5.18
SOGA1O94964 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC47.39■■■■■ 5.18
SOGA1O94964 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC47.39■■■■■ 5.18
SOGA1O94964 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC47.38■■■■■ 5.17
SOGA1O94964 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC47.36■■■■■ 5.17
SOGA1O94964 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC47.36■■■■■ 5.17
SOGA1O94964 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC47.36■■■■■ 5.17
SOGA1O94964 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.36■■■■■ 5.17
SOGA1O94964 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
SOGA1O94964 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.34■■■■■ 5.17
SOGA1O94964 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC47.3■■■■■ 5.16
SOGA1O94964 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.28■■■■■ 5.16
SOGA1O94964 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.28■■■■■ 5.16
SOGA1O94964 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC47.28■■■■■ 5.16
SOGA1O94964 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC47.26■■■■■ 5.16
SOGA1O94964 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC47.25■■■■■ 5.15
SOGA1O94964 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC47.24■■■■■ 5.15
SOGA1O94964 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.22■■■■■ 5.15
SOGA1O94964 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.17■■■■■ 5.14
SOGA1O94964 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.17■■■■■ 5.14
SOGA1O94964 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
SOGA1O94964 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC47.12■■■■■ 5.13
SOGA1O94964 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC47.11■■■■■ 5.13
SOGA1O94964 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
SOGA1O94964 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.09■■■■■ 5.13
SOGA1O94964 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
SOGA1O94964 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
SOGA1O94964 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
SOGA1O94964 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
SOGA1O94964 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC47.07■■■■■ 5.13
SOGA1O94964 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC47.06■■■■■ 5.12
SOGA1O94964 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC47.05■■■■■ 5.12
SOGA1O94964 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC47.03■■■■■ 5.12
SOGA1O94964 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC47.02■■■■■ 5.12
SOGA1O94964 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC47.02■■■■■ 5.12
SOGA1O94964 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC47.01■■■■■ 5.12
SOGA1O94964 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC47■■■■■ 5.11
SOGA1O94964 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC47■■■■■ 5.11
SOGA1O94964 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47■■■■■ 5.11
SOGA1O94964 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC46.99■■■■■ 5.11
SOGA1O94964 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC46.99■■■■■ 5.11
SOGA1O94964 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC46.99■■■■■ 5.11
SOGA1O94964 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
SOGA1O94964 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
SOGA1O94964 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
SOGA1O94964 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.11
SOGA1O94964 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.94■■■■■ 5.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms