Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNKO75909 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNKO75909 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNKO75909 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNKO75909 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNKO75909 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNKO75909 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNKO75909 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNKO75909 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCNKO75909 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNKO75909 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCNKO75909 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCNKO75909 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNKO75909 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCNKO75909 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCNKO75909 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCNKO75909 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNKO75909 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCNKO75909 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCNKO75909 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCNKO75909 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCNKO75909 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNKO75909 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNKO75909 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNKO75909 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNKO75909 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCNKO75909 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCNKO75909 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCNKO75909 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNKO75909 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCNKO75909 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNKO75909 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CCNKO75909 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CCNKO75909 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNKO75909 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNKO75909 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CCNKO75909 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CCNKO75909 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CCNKO75909 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNKO75909 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNKO75909 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CCNKO75909 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CCNKO75909 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNKO75909 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CCNKO75909 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CCNKO75909 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CCNKO75909 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNKO75909 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNKO75909 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNKO75909 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNKO75909 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CCNKO75909 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CCNKO75909 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNKO75909 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNKO75909 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNKO75909 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CCNKO75909 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNKO75909 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNKO75909 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CCNKO75909 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNKO75909 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CCNKO75909 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNKO75909 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CCNKO75909 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNKO75909 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNKO75909 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CCNKO75909 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNKO75909 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNKO75909 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CCNKO75909 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNKO75909 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CCNKO75909 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNKO75909 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNKO75909 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNKO75909 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CCNKO75909 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNKO75909 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNKO75909 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CCNKO75909 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNKO75909 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNKO75909 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CCNKO75909 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNKO75909 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CCNKO75909 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCNKO75909 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCNKO75909 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCNKO75909 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNKO75909 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNKO75909 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCNKO75909 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNKO75909 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCNKO75909 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCNKO75909 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCNKO75909 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNKO75909 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNKO75909 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNKO75909 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNKO75909 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCNKO75909 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCNKO75909 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms