Protein–RNA interactions for Protein: O75718

CRTAP, Cartilage-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAPO75718 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRTAPO75718 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CRTAPO75718 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRTAPO75718 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CRTAPO75718 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRTAPO75718 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CRTAPO75718 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CRTAPO75718 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CRTAPO75718 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRTAPO75718 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CRTAPO75718 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CRTAPO75718 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CRTAPO75718 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRTAPO75718 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CRTAPO75718 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRTAPO75718 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRTAPO75718 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRTAPO75718 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRTAPO75718 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRTAPO75718 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRTAPO75718 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRTAPO75718 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRTAPO75718 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRTAPO75718 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRTAPO75718 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRTAPO75718 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRTAPO75718 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CRTAPO75718 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CRTAPO75718 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRTAPO75718 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CRTAPO75718 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CRTAPO75718 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CRTAPO75718 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRTAPO75718 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CRTAPO75718 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CRTAPO75718 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CRTAPO75718 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRTAPO75718 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CRTAPO75718 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRTAPO75718 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CRTAPO75718 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CRTAPO75718 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CRTAPO75718 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CRTAPO75718 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRTAPO75718 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CRTAPO75718 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CRTAPO75718 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRTAPO75718 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CRTAPO75718 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRTAPO75718 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRTAPO75718 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRTAPO75718 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CRTAPO75718 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRTAPO75718 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CRTAPO75718 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRTAPO75718 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRTAPO75718 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CRTAPO75718 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRTAPO75718 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRTAPO75718 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CRTAPO75718 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRTAPO75718 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRTAPO75718 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CRTAPO75718 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRTAPO75718 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CRTAPO75718 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRTAPO75718 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CRTAPO75718 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CRTAPO75718 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRTAPO75718 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CRTAPO75718 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CRTAPO75718 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRTAPO75718 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CRTAPO75718 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CRTAPO75718 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRTAPO75718 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CRTAPO75718 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRTAPO75718 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRTAPO75718 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CRTAPO75718 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRTAPO75718 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRTAPO75718 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRTAPO75718 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CRTAPO75718 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRTAPO75718 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CRTAPO75718 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRTAPO75718 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CRTAPO75718 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CRTAPO75718 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CRTAPO75718 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRTAPO75718 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CRTAPO75718 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRTAPO75718 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CRTAPO75718 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRTAPO75718 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRTAPO75718 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CRTAPO75718 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CRTAPO75718 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAPO75718 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CRTAPO75718 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms