Protein–RNA interactions for Protein: O75409

HYPM, Huntingtin-interacting protein M, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HYPMO75409 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HYPMO75409 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HYPMO75409 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HYPMO75409 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HYPMO75409 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HYPMO75409 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HYPMO75409 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HYPMO75409 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HYPMO75409 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HYPMO75409 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HYPMO75409 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HYPMO75409 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HYPMO75409 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HYPMO75409 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HYPMO75409 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HYPMO75409 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HYPMO75409 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HYPMO75409 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
HYPMO75409 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HYPMO75409 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HYPMO75409 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HYPMO75409 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HYPMO75409 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HYPMO75409 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HYPMO75409 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HYPMO75409 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HYPMO75409 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HYPMO75409 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HYPMO75409 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HYPMO75409 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HYPMO75409 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HYPMO75409 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HYPMO75409 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HYPMO75409 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HYPMO75409 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HYPMO75409 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HYPMO75409 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HYPMO75409 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HYPMO75409 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HYPMO75409 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HYPMO75409 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HYPMO75409 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HYPMO75409 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HYPMO75409 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HYPMO75409 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
HYPMO75409 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HYPMO75409 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HYPMO75409 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
HYPMO75409 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HYPMO75409 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HYPMO75409 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HYPMO75409 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HYPMO75409 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HYPMO75409 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HYPMO75409 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HYPMO75409 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HYPMO75409 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HYPMO75409 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HYPMO75409 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HYPMO75409 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HYPMO75409 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HYPMO75409 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HYPMO75409 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HYPMO75409 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HYPMO75409 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HYPMO75409 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HYPMO75409 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HYPMO75409 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HYPMO75409 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HYPMO75409 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HYPMO75409 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HYPMO75409 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HYPMO75409 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HYPMO75409 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HYPMO75409 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HYPMO75409 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HYPMO75409 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HYPMO75409 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HYPMO75409 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HYPMO75409 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HYPMO75409 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HYPMO75409 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HYPMO75409 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HYPMO75409 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HYPMO75409 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HYPMO75409 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HYPMO75409 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HYPMO75409 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HYPMO75409 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HYPMO75409 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HYPMO75409 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HYPMO75409 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HYPMO75409 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HYPMO75409 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HYPMO75409 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HYPMO75409 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HYPMO75409 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HYPMO75409 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HYPMO75409 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HYPMO75409 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms