Protein–RNA interactions for Protein: O75340

PDCD6, Programmed cell death protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD6O75340 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PDCD6O75340 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDCD6O75340 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PDCD6O75340 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PDCD6O75340 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PDCD6O75340 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD6O75340 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PDCD6O75340 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PDCD6O75340 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD6O75340 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD6O75340 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD6O75340 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PDCD6O75340 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCD6O75340 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCD6O75340 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PDCD6O75340 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PDCD6O75340 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PDCD6O75340 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCD6O75340 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PDCD6O75340 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PDCD6O75340 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCD6O75340 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PDCD6O75340 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD6O75340 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PDCD6O75340 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD6O75340 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD6O75340 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD6O75340 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PDCD6O75340 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PDCD6O75340 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCD6O75340 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCD6O75340 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCD6O75340 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCD6O75340 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PDCD6O75340 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCD6O75340 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCD6O75340 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCD6O75340 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PDCD6O75340 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PDCD6O75340 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCD6O75340 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PDCD6O75340 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCD6O75340 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PDCD6O75340 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PDCD6O75340 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCD6O75340 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PDCD6O75340 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCD6O75340 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PDCD6O75340 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PDCD6O75340 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PDCD6O75340 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD6O75340 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD6O75340 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD6O75340 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PDCD6O75340 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD6O75340 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PDCD6O75340 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD6O75340 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PDCD6O75340 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PDCD6O75340 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCD6O75340 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDCD6O75340 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCD6O75340 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDCD6O75340 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCD6O75340 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD6O75340 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCD6O75340 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD6O75340 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD6O75340 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD6O75340 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD6O75340 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCD6O75340 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCD6O75340 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD6O75340 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD6O75340 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCD6O75340 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD6O75340 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCD6O75340 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD6O75340 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD6O75340 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCD6O75340 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PDCD6O75340 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDCD6O75340 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD6O75340 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDCD6O75340 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD6O75340 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD6O75340 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD6O75340 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDCD6O75340 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD6O75340 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD6O75340 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD6O75340 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCD6O75340 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCD6O75340 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCD6O75340 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCD6O75340 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCD6O75340 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCD6O75340 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDCD6O75340 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDCD6O75340 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms