Protein–RNA interactions for Protein: O60930

RNASEH1, Ribonuclease H1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASEH1O60930 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RNASEH1O60930 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RNASEH1O60930 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RNASEH1O60930 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RNASEH1O60930 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RNASEH1O60930 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RNASEH1O60930 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RNASEH1O60930 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
RNASEH1O60930 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNASEH1O60930 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RNASEH1O60930 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RNASEH1O60930 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNASEH1O60930 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNASEH1O60930 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
RNASEH1O60930 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNASEH1O60930 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNASEH1O60930 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNASEH1O60930 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNASEH1O60930 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNASEH1O60930 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RNASEH1O60930 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNASEH1O60930 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNASEH1O60930 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RNASEH1O60930 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNASEH1O60930 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNASEH1O60930 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RNASEH1O60930 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNASEH1O60930 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
RNASEH1O60930 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
RNASEH1O60930 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNASEH1O60930 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RNASEH1O60930 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
RNASEH1O60930 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RNASEH1O60930 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
RNASEH1O60930 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNASEH1O60930 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RNASEH1O60930 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNASEH1O60930 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNASEH1O60930 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RNASEH1O60930 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RNASEH1O60930 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RNASEH1O60930 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
RNASEH1O60930 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RNASEH1O60930 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RNASEH1O60930 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNASEH1O60930 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RNASEH1O60930 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RNASEH1O60930 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RNASEH1O60930 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNASEH1O60930 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNASEH1O60930 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RNASEH1O60930 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RNASEH1O60930 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RNASEH1O60930 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNASEH1O60930 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNASEH1O60930 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNASEH1O60930 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNASEH1O60930 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNASEH1O60930 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RNASEH1O60930 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RNASEH1O60930 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNASEH1O60930 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNASEH1O60930 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNASEH1O60930 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNASEH1O60930 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNASEH1O60930 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNASEH1O60930 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNASEH1O60930 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNASEH1O60930 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNASEH1O60930 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNASEH1O60930 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNASEH1O60930 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNASEH1O60930 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNASEH1O60930 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNASEH1O60930 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNASEH1O60930 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNASEH1O60930 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RNASEH1O60930 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNASEH1O60930 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNASEH1O60930 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNASEH1O60930 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RNASEH1O60930 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNASEH1O60930 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNASEH1O60930 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNASEH1O60930 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNASEH1O60930 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNASEH1O60930 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNASEH1O60930 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RNASEH1O60930 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RNASEH1O60930 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNASEH1O60930 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RNASEH1O60930 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNASEH1O60930 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RNASEH1O60930 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNASEH1O60930 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RNASEH1O60930 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RNASEH1O60930 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RNASEH1O60930 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RNASEH1O60930 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RNASEH1O60930 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms