Protein–RNA interactions for Protein: O60882

MMP20, Matrix metalloproteinase-20, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP20O60882 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP20O60882 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP20O60882 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP20O60882 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
MMP20O60882 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MMP20O60882 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MMP20O60882 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
MMP20O60882 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
MMP20O60882 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MMP20O60882 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMP20O60882 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMP20O60882 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
MMP20O60882 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
MMP20O60882 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
MMP20O60882 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMP20O60882 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
MMP20O60882 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
MMP20O60882 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP20O60882 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP20O60882 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP20O60882 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
MMP20O60882 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
MMP20O60882 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
MMP20O60882 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
MMP20O60882 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP20O60882 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
MMP20O60882 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
MMP20O60882 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP20O60882 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
MMP20O60882 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MMP20O60882 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MMP20O60882 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP20O60882 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP20O60882 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
MMP20O60882 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP20O60882 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP20O60882 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP20O60882 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP20O60882 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP20O60882 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP20O60882 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP20O60882 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP20O60882 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP20O60882 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP20O60882 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MMP20O60882 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MMP20O60882 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
MMP20O60882 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.53■■■□□ 2
MMP20O60882 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
MMP20O60882 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
MMP20O60882 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MMP20O60882 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
MMP20O60882 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
MMP20O60882 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
MMP20O60882 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP20O60882 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP20O60882 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
MMP20O60882 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP20O60882 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP20O60882 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
MMP20O60882 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
MMP20O60882 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
MMP20O60882 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
MMP20O60882 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
MMP20O60882 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP20O60882 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
MMP20O60882 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP20O60882 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
MMP20O60882 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
MMP20O60882 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
MMP20O60882 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP20O60882 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP20O60882 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP20O60882 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MMP20O60882 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MMP20O60882 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP20O60882 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP20O60882 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP20O60882 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MMP20O60882 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP20O60882 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP20O60882 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP20O60882 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MMP20O60882 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP20O60882 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MMP20O60882 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP20O60882 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP20O60882 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP20O60882 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MMP20O60882 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP20O60882 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MMP20O60882 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP20O60882 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MMP20O60882 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MMP20O60882 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP20O60882 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP20O60882 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MMP20O60882 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MMP20O60882 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP20O60882 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms