Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRAMEF2O60811 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRAMEF2O60811 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRAMEF2O60811 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF2O60811 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRAMEF2O60811 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRAMEF2O60811 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRAMEF2O60811 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF2O60811 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF2O60811 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF2O60811 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRAMEF2O60811 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRAMEF2O60811 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF2O60811 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRAMEF2O60811 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF2O60811 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF2O60811 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRAMEF2O60811 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRAMEF2O60811 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF2O60811 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF2O60811 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF2O60811 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRAMEF2O60811 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRAMEF2O60811 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRAMEF2O60811 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRAMEF2O60811 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF2O60811 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF2O60811 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF2O60811 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRAMEF2O60811 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF2O60811 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PRAMEF2O60811 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF2O60811 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRAMEF2O60811 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF2O60811 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF2O60811 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF2O60811 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRAMEF2O60811 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF2O60811 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRAMEF2O60811 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF2O60811 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRAMEF2O60811 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF2O60811 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF2O60811 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRAMEF2O60811 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF2O60811 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF2O60811 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRAMEF2O60811 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRAMEF2O60811 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF2O60811 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRAMEF2O60811 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF2O60811 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRAMEF2O60811 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF2O60811 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF2O60811 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF2O60811 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRAMEF2O60811 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRAMEF2O60811 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF2O60811 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRAMEF2O60811 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRAMEF2O60811 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PRAMEF2O60811 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PRAMEF2O60811 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF2O60811 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF2O60811 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PRAMEF2O60811 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF2O60811 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF2O60811 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRAMEF2O60811 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PRAMEF2O60811 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PRAMEF2O60811 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF2O60811 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRAMEF2O60811 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF2O60811 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRAMEF2O60811 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF2O60811 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PRAMEF2O60811 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRAMEF2O60811 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRAMEF2O60811 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF2O60811 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF2O60811 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRAMEF2O60811 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRAMEF2O60811 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PRAMEF2O60811 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF2O60811 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PRAMEF2O60811 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF2O60811 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF2O60811 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF2O60811 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF2O60811 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF2O60811 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF2O60811 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF2O60811 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF2O60811 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRAMEF2O60811 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF2O60811 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF2O60811 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF2O60811 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF2O60811 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF2O60811 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms