Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CACNG3O60359 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CACNG3O60359 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CACNG3O60359 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CACNG3O60359 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CACNG3O60359 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CACNG3O60359 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CACNG3O60359 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CACNG3O60359 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CACNG3O60359 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CACNG3O60359 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CACNG3O60359 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNG3O60359 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CACNG3O60359 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNG3O60359 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNG3O60359 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNG3O60359 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CACNG3O60359 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CACNG3O60359 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CACNG3O60359 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CACNG3O60359 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CACNG3O60359 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNG3O60359 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNG3O60359 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CACNG3O60359 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CACNG3O60359 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CACNG3O60359 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CACNG3O60359 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CACNG3O60359 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CACNG3O60359 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNG3O60359 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CACNG3O60359 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNG3O60359 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNG3O60359 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CACNG3O60359 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CACNG3O60359 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNG3O60359 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CACNG3O60359 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNG3O60359 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CACNG3O60359 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CACNG3O60359 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CACNG3O60359 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNG3O60359 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CACNG3O60359 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CACNG3O60359 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNG3O60359 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CACNG3O60359 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CACNG3O60359 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CACNG3O60359 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CACNG3O60359 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNG3O60359 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CACNG3O60359 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNG3O60359 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNG3O60359 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNG3O60359 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CACNG3O60359 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNG3O60359 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CACNG3O60359 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CACNG3O60359 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNG3O60359 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CACNG3O60359 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CACNG3O60359 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNG3O60359 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CACNG3O60359 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNG3O60359 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CACNG3O60359 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNG3O60359 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CACNG3O60359 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNG3O60359 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNG3O60359 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CACNG3O60359 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CACNG3O60359 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNG3O60359 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNG3O60359 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CACNG3O60359 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNG3O60359 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNG3O60359 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CACNG3O60359 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CACNG3O60359 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNG3O60359 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNG3O60359 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CACNG3O60359 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CACNG3O60359 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNG3O60359 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CACNG3O60359 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CACNG3O60359 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CACNG3O60359 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNG3O60359 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CACNG3O60359 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNG3O60359 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNG3O60359 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNG3O60359 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CACNG3O60359 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CACNG3O60359 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
CACNG3O60359 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CACNG3O60359 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNG3O60359 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNG3O60359 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CACNG3O60359 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CACNG3O60359 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms