Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
DHX16O60231 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
DHX16O60231 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
DHX16O60231 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
DHX16O60231 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DHX16O60231 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
DHX16O60231 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
DHX16O60231 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
DHX16O60231 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
DHX16O60231 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
DHX16O60231 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
DHX16O60231 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
DHX16O60231 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
DHX16O60231 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
DHX16O60231 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
DHX16O60231 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
DHX16O60231 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
DHX16O60231 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
DHX16O60231 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
DHX16O60231 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
DHX16O60231 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
DHX16O60231 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
DHX16O60231 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
DHX16O60231 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
DHX16O60231 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
DHX16O60231 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
DHX16O60231 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
DHX16O60231 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
DHX16O60231 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
DHX16O60231 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
DHX16O60231 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.49■■■□□ 2.79
DHX16O60231 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DHX16O60231 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
DHX16O60231 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
DHX16O60231 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
DHX16O60231 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
DHX16O60231 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
DHX16O60231 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
DHX16O60231 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
DHX16O60231 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
DHX16O60231 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
DHX16O60231 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
DHX16O60231 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
DHX16O60231 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
DHX16O60231 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
DHX16O60231 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
DHX16O60231 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
DHX16O60231 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
DHX16O60231 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
DHX16O60231 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
DHX16O60231 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
DHX16O60231 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
DHX16O60231 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
DHX16O60231 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
DHX16O60231 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
DHX16O60231 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
DHX16O60231 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
DHX16O60231 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
DHX16O60231 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
DHX16O60231 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
DHX16O60231 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
DHX16O60231 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
DHX16O60231 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
DHX16O60231 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
DHX16O60231 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
DHX16O60231 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
DHX16O60231 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
DHX16O60231 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
DHX16O60231 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
DHX16O60231 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
DHX16O60231 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DHX16O60231 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
DHX16O60231 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
DHX16O60231 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
DHX16O60231 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
DHX16O60231 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
DHX16O60231 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
DHX16O60231 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
DHX16O60231 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
DHX16O60231 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
DHX16O60231 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
DHX16O60231 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
DHX16O60231 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
DHX16O60231 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
DHX16O60231 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DHX16O60231 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
DHX16O60231 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
DHX16O60231 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
DHX16O60231 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
DHX16O60231 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
DHX16O60231 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
DHX16O60231 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
DHX16O60231 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
DHX16O60231 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
DHX16O60231 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
DHX16O60231 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
DHX16O60231 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
DHX16O60231 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DHX16O60231 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
DHX16O60231 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms