Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
EFNA2O43921 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EFNA2O43921 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
EFNA2O43921 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
EFNA2O43921 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EFNA2O43921 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EFNA2O43921 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFNA2O43921 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFNA2O43921 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EFNA2O43921 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EFNA2O43921 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFNA2O43921 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
EFNA2O43921 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFNA2O43921 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EFNA2O43921 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFNA2O43921 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFNA2O43921 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFNA2O43921 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFNA2O43921 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EFNA2O43921 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFNA2O43921 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFNA2O43921 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EFNA2O43921 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFNA2O43921 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFNA2O43921 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFNA2O43921 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EFNA2O43921 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFNA2O43921 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFNA2O43921 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EFNA2O43921 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EFNA2O43921 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EFNA2O43921 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EFNA2O43921 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EFNA2O43921 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EFNA2O43921 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EFNA2O43921 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
EFNA2O43921 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EFNA2O43921 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
EFNA2O43921 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFNA2O43921 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EFNA2O43921 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EFNA2O43921 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EFNA2O43921 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFNA2O43921 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EFNA2O43921 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EFNA2O43921 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFNA2O43921 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EFNA2O43921 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFNA2O43921 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EFNA2O43921 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFNA2O43921 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EFNA2O43921 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFNA2O43921 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFNA2O43921 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EFNA2O43921 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EFNA2O43921 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EFNA2O43921 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EFNA2O43921 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
EFNA2O43921 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFNA2O43921 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFNA2O43921 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
EFNA2O43921 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFNA2O43921 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
EFNA2O43921 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFNA2O43921 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFNA2O43921 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EFNA2O43921 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFNA2O43921 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EFNA2O43921 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EFNA2O43921 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EFNA2O43921 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFNA2O43921 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFNA2O43921 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFNA2O43921 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EFNA2O43921 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EFNA2O43921 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFNA2O43921 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EFNA2O43921 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFNA2O43921 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
EFNA2O43921 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFNA2O43921 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EFNA2O43921 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFNA2O43921 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
EFNA2O43921 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
EFNA2O43921 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
EFNA2O43921 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFNA2O43921 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFNA2O43921 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFNA2O43921 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFNA2O43921 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
EFNA2O43921 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFNA2O43921 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFNA2O43921 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EFNA2O43921 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EFNA2O43921 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EFNA2O43921 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
EFNA2O43921 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFNA2O43921 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFNA2O43921 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFNA2O43921 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms