Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP9BO43861 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATP9BO43861 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ATP9BO43861 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP9BO43861 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ATP9BO43861 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ATP9BO43861 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP9BO43861 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP9BO43861 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP9BO43861 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATP9BO43861 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP9BO43861 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP9BO43861 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATP9BO43861 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATP9BO43861 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATP9BO43861 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATP9BO43861 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP9BO43861 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP9BO43861 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATP9BO43861 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATP9BO43861 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ATP9BO43861 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP9BO43861 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATP9BO43861 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP9BO43861 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATP9BO43861 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP9BO43861 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP9BO43861 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATP9BO43861 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP9BO43861 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP9BO43861 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATP9BO43861 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP9BO43861 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATP9BO43861 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP9BO43861 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATP9BO43861 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP9BO43861 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATP9BO43861 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP9BO43861 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATP9BO43861 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ATP9BO43861 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
ATP9BO43861 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP9BO43861 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP9BO43861 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP9BO43861 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP9BO43861 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP9BO43861 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP9BO43861 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP9BO43861 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP9BO43861 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATP9BO43861 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP9BO43861 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP9BO43861 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP9BO43861 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP9BO43861 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP9BO43861 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP9BO43861 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP9BO43861 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP9BO43861 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP9BO43861 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ATP9BO43861 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP9BO43861 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP9BO43861 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP9BO43861 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP9BO43861 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP9BO43861 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP9BO43861 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP9BO43861 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP9BO43861 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP9BO43861 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP9BO43861 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP9BO43861 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP9BO43861 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP9BO43861 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP9BO43861 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP9BO43861 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP9BO43861 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP9BO43861 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP9BO43861 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP9BO43861 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP9BO43861 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ATP9BO43861 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP9BO43861 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP9BO43861 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP9BO43861 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP9BO43861 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP9BO43861 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP9BO43861 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP9BO43861 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP9BO43861 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP9BO43861 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP9BO43861 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP9BO43861 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP9BO43861 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP9BO43861 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP9BO43861 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP9BO43861 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ATP9BO43861 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATP9BO43861 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATP9BO43861 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms