Protein–RNA interactions for Protein: O43617

TRAPPC3, Trafficking protein particle complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3O43617 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC3O43617 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TRAPPC3O43617 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TRAPPC3O43617 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC3O43617 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC3O43617 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
TRAPPC3O43617 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TRAPPC3O43617 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TRAPPC3O43617 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TRAPPC3O43617 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC3O43617 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TRAPPC3O43617 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC3O43617 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TRAPPC3O43617 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC3O43617 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC3O43617 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC3O43617 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC3O43617 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TRAPPC3O43617 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TRAPPC3O43617 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRAPPC3O43617 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TRAPPC3O43617 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TRAPPC3O43617 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC3O43617 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TRAPPC3O43617 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TRAPPC3O43617 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TRAPPC3O43617 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC3O43617 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC3O43617 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TRAPPC3O43617 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC3O43617 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TRAPPC3O43617 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TRAPPC3O43617 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC3O43617 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TRAPPC3O43617 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC3O43617 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TRAPPC3O43617 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC3O43617 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TRAPPC3O43617 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TRAPPC3O43617 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAPPC3O43617 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TRAPPC3O43617 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TRAPPC3O43617 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TRAPPC3O43617 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TRAPPC3O43617 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TRAPPC3O43617 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TRAPPC3O43617 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TRAPPC3O43617 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TRAPPC3O43617 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC3O43617 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC3O43617 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC3O43617 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TRAPPC3O43617 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TRAPPC3O43617 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC3O43617 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC3O43617 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TRAPPC3O43617 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAPPC3O43617 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAPPC3O43617 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TRAPPC3O43617 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC3O43617 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TRAPPC3O43617 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC3O43617 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC3O43617 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TRAPPC3O43617 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TRAPPC3O43617 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAPPC3O43617 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAPPC3O43617 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TRAPPC3O43617 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC3O43617 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TRAPPC3O43617 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TRAPPC3O43617 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC3O43617 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TRAPPC3O43617 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAPPC3O43617 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TRAPPC3O43617 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAPPC3O43617 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TRAPPC3O43617 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC3O43617 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TRAPPC3O43617 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC3O43617 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TRAPPC3O43617 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAPPC3O43617 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TRAPPC3O43617 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TRAPPC3O43617 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAPPC3O43617 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
TRAPPC3O43617 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
TRAPPC3O43617 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC3O43617 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC3O43617 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC3O43617 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TRAPPC3O43617 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
TRAPPC3O43617 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TRAPPC3O43617 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
TRAPPC3O43617 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
TRAPPC3O43617 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC3O43617 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TRAPPC3O43617 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC3O43617 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
TRAPPC3O43617 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms