Protein–RNA interactions for Protein: O43508

TNFSF12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12O43508 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF12O43508 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TNFSF12O43508 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TNFSF12O43508 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TNFSF12O43508 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12O43508 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12O43508 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12O43508 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TNFSF12O43508 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TNFSF12O43508 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNFSF12O43508 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF12O43508 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNFSF12O43508 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNFSF12O43508 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF12O43508 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNFSF12O43508 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF12O43508 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF12O43508 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNFSF12O43508 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF12O43508 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF12O43508 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF12O43508 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF12O43508 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF12O43508 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF12O43508 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF12O43508 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF12O43508 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF12O43508 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF12O43508 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF12O43508 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TNFSF12O43508 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF12O43508 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF12O43508 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF12O43508 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TNFSF12O43508 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF12O43508 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF12O43508 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF12O43508 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TNFSF12O43508 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF12O43508 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TNFSF12O43508 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF12O43508 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF12O43508 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TNFSF12O43508 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TNFSF12O43508 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF12O43508 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TNFSF12O43508 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF12O43508 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TNFSF12O43508 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF12O43508 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TNFSF12O43508 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TNFSF12O43508 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF12O43508 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TNFSF12O43508 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF12O43508 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF12O43508 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF12O43508 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF12O43508 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TNFSF12O43508 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TNFSF12O43508 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TNFSF12O43508 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TNFSF12O43508 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF12O43508 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TNFSF12O43508 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12O43508 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TNFSF12O43508 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF12O43508 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF12O43508 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TNFSF12O43508 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF12O43508 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF12O43508 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF12O43508 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TNFSF12O43508 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF12O43508 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF12O43508 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TNFSF12O43508 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TNFSF12O43508 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFSF12O43508 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF12O43508 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF12O43508 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF12O43508 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF12O43508 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF12O43508 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFSF12O43508 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF12O43508 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF12O43508 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF12O43508 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF12O43508 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFSF12O43508 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFSF12O43508 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF12O43508 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF12O43508 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF12O43508 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFSF12O43508 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF12O43508 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF12O43508 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFSF12O43508 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFSF12O43508 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFSF12O43508 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFSF12O43508 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms