Protein–RNA interactions for Protein: O15522

NKX2-8, Homeobox protein Nkx-2.8, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-8O15522 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NKX2-8O15522 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NKX2-8O15522 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKX2-8O15522 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKX2-8O15522 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
NKX2-8O15522 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NKX2-8O15522 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NKX2-8O15522 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NKX2-8O15522 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NKX2-8O15522 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NKX2-8O15522 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NKX2-8O15522 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NKX2-8O15522 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NKX2-8O15522 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NKX2-8O15522 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NKX2-8O15522 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NKX2-8O15522 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NKX2-8O15522 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NKX2-8O15522 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NKX2-8O15522 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NKX2-8O15522 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NKX2-8O15522 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NKX2-8O15522 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NKX2-8O15522 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NKX2-8O15522 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NKX2-8O15522 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NKX2-8O15522 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NKX2-8O15522 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NKX2-8O15522 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NKX2-8O15522 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NKX2-8O15522 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NKX2-8O15522 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NKX2-8O15522 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NKX2-8O15522 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NKX2-8O15522 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NKX2-8O15522 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NKX2-8O15522 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NKX2-8O15522 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NKX2-8O15522 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NKX2-8O15522 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NKX2-8O15522 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NKX2-8O15522 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKX2-8O15522 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKX2-8O15522 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NKX2-8O15522 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NKX2-8O15522 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKX2-8O15522 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NKX2-8O15522 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NKX2-8O15522 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NKX2-8O15522 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NKX2-8O15522 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NKX2-8O15522 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKX2-8O15522 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKX2-8O15522 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKX2-8O15522 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKX2-8O15522 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NKX2-8O15522 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX2-8O15522 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX2-8O15522 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NKX2-8O15522 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKX2-8O15522 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKX2-8O15522 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKX2-8O15522 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NKX2-8O15522 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NKX2-8O15522 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NKX2-8O15522 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX2-8O15522 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NKX2-8O15522 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NKX2-8O15522 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
NKX2-8O15522 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NKX2-8O15522 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKX2-8O15522 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKX2-8O15522 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NKX2-8O15522 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NKX2-8O15522 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NKX2-8O15522 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX2-8O15522 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NKX2-8O15522 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX2-8O15522 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX2-8O15522 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NKX2-8O15522 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX2-8O15522 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NKX2-8O15522 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX2-8O15522 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NKX2-8O15522 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKX2-8O15522 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NKX2-8O15522 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX2-8O15522 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NKX2-8O15522 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NKX2-8O15522 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NKX2-8O15522 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX2-8O15522 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NKX2-8O15522 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX2-8O15522 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NKX2-8O15522 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NKX2-8O15522 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
NKX2-8O15522 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX2-8O15522 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NKX2-8O15522 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NKX2-8O15522 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms