Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARPC5O15511 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARPC5O15511 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARPC5O15511 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARPC5O15511 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARPC5O15511 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARPC5O15511 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARPC5O15511 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARPC5O15511 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARPC5O15511 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARPC5O15511 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARPC5O15511 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARPC5O15511 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ARPC5O15511 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARPC5O15511 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARPC5O15511 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARPC5O15511 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARPC5O15511 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARPC5O15511 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARPC5O15511 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARPC5O15511 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARPC5O15511 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARPC5O15511 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARPC5O15511 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARPC5O15511 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARPC5O15511 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARPC5O15511 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARPC5O15511 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARPC5O15511 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARPC5O15511 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARPC5O15511 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARPC5O15511 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARPC5O15511 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARPC5O15511 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARPC5O15511 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARPC5O15511 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARPC5O15511 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARPC5O15511 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARPC5O15511 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARPC5O15511 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARPC5O15511 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARPC5O15511 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARPC5O15511 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARPC5O15511 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARPC5O15511 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARPC5O15511 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARPC5O15511 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARPC5O15511 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARPC5O15511 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARPC5O15511 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARPC5O15511 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARPC5O15511 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARPC5O15511 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ARPC5O15511 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARPC5O15511 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARPC5O15511 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ARPC5O15511 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARPC5O15511 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ARPC5O15511 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARPC5O15511 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARPC5O15511 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARPC5O15511 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARPC5O15511 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ARPC5O15511 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARPC5O15511 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ARPC5O15511 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ARPC5O15511 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ARPC5O15511 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARPC5O15511 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARPC5O15511 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ARPC5O15511 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARPC5O15511 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ARPC5O15511 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARPC5O15511 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ARPC5O15511 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARPC5O15511 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ARPC5O15511 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARPC5O15511 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARPC5O15511 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ARPC5O15511 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ARPC5O15511 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARPC5O15511 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARPC5O15511 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ARPC5O15511 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ARPC5O15511 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARPC5O15511 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARPC5O15511 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ARPC5O15511 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARPC5O15511 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARPC5O15511 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARPC5O15511 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ARPC5O15511 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ARPC5O15511 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARPC5O15511 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARPC5O15511 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARPC5O15511 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARPC5O15511 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARPC5O15511 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARPC5O15511 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARPC5O15511 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms