Protein–RNA interactions for Protein: O15393

TMPRSS2, Transmembrane protease serine 2, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS2O15393 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMPRSS2O15393 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMPRSS2O15393 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMPRSS2O15393 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMPRSS2O15393 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS2O15393 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS2O15393 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMPRSS2O15393 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMPRSS2O15393 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS2O15393 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS2O15393 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMPRSS2O15393 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS2O15393 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMPRSS2O15393 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS2O15393 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMPRSS2O15393 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS2O15393 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMPRSS2O15393 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS2O15393 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMPRSS2O15393 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMPRSS2O15393 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMPRSS2O15393 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS2O15393 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS2O15393 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS2O15393 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMPRSS2O15393 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMPRSS2O15393 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS2O15393 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS2O15393 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS2O15393 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMPRSS2O15393 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMPRSS2O15393 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS2O15393 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS2O15393 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMPRSS2O15393 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS2O15393 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMPRSS2O15393 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS2O15393 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS2O15393 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS2O15393 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMPRSS2O15393 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMPRSS2O15393 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS2O15393 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMPRSS2O15393 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMPRSS2O15393 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS2O15393 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS2O15393 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS2O15393 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMPRSS2O15393 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMPRSS2O15393 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMPRSS2O15393 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS2O15393 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMPRSS2O15393 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMPRSS2O15393 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS2O15393 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TMPRSS2O15393 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS2O15393 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMPRSS2O15393 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS2O15393 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS2O15393 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS2O15393 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS2O15393 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMPRSS2O15393 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMPRSS2O15393 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS2O15393 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS2O15393 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMPRSS2O15393 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS2O15393 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS2O15393 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMPRSS2O15393 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS2O15393 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMPRSS2O15393 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMPRSS2O15393 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS2O15393 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS2O15393 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS2O15393 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMPRSS2O15393 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMPRSS2O15393 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMPRSS2O15393 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS2O15393 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS2O15393 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMPRSS2O15393 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS2O15393 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS2O15393 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TMPRSS2O15393 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS2O15393 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMPRSS2O15393 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS2O15393 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMPRSS2O15393 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMPRSS2O15393 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS2O15393 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS2O15393 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS2O15393 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS2O15393 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS2O15393 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS2O15393 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS2O15393 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS2O15393 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS2O15393 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS2O15393 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.4 ms