Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
FANCAO15360 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
FANCAO15360 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
FANCAO15360 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
FANCAO15360 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
FANCAO15360 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
FANCAO15360 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
FANCAO15360 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.6■■■■■ 4.57
FANCAO15360 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
FANCAO15360 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.56■■■■■ 4.56
FANCAO15360 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
FANCAO15360 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
FANCAO15360 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
FANCAO15360 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
FANCAO15360 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
FANCAO15360 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
FANCAO15360 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
FANCAO15360 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
FANCAO15360 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
FANCAO15360 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC43.44■■■■■ 4.54
FANCAO15360 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC43.42■■■■■ 4.54
FANCAO15360 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
FANCAO15360 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
FANCAO15360 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
FANCAO15360 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
FANCAO15360 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
FANCAO15360 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC43.38■■■■■ 4.53
FANCAO15360 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC43.37■■■■■ 4.53
FANCAO15360 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
FANCAO15360 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC43.34■■■■■ 4.53
FANCAO15360 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
FANCAO15360 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
FANCAO15360 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
FANCAO15360 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC43.24■■■■■ 4.51
FANCAO15360 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
FANCAO15360 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
FANCAO15360 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.51
FANCAO15360 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
FANCAO15360 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC43.18■■■■■ 4.5
FANCAO15360 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC43.16■■■■■ 4.5
FANCAO15360 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
FANCAO15360 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
FANCAO15360 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
FANCAO15360 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
FANCAO15360 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC43.13■■■■■ 4.5
FANCAO15360 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
FANCAO15360 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
FANCAO15360 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
FANCAO15360 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
FANCAO15360 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC43.08■■■■■ 4.49
FANCAO15360 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC43.07■■■■■ 4.49
FANCAO15360 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC43.06■■■■■ 4.48
FANCAO15360 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
FANCAO15360 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.01■■■■■ 4.48
FANCAO15360 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
FANCAO15360 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
FANCAO15360 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC43.01■■■■■ 4.48
FANCAO15360 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC43■■■■■ 4.47
FANCAO15360 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
FANCAO15360 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.94■■■■■ 4.46
FANCAO15360 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
FANCAO15360 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
FANCAO15360 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
FANCAO15360 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
FANCAO15360 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC42.85■■■■■ 4.45
FANCAO15360 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
FANCAO15360 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
FANCAO15360 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
FANCAO15360 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
FANCAO15360 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
FANCAO15360 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC42.81■■■■■ 4.44
FANCAO15360 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC42.81■■■■■ 4.44
FANCAO15360 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
FANCAO15360 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
FANCAO15360 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
FANCAO15360 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
FANCAO15360 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
FANCAO15360 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
FANCAO15360 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
FANCAO15360 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
FANCAO15360 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
FANCAO15360 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
FANCAO15360 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
FANCAO15360 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
FANCAO15360 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
FANCAO15360 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
FANCAO15360 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
FANCAO15360 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC42.65■■■■■ 4.42
FANCAO15360 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
FANCAO15360 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
FANCAO15360 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
FANCAO15360 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC42.6■■■■■ 4.41
FANCAO15360 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
FANCAO15360 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
FANCAO15360 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
FANCAO15360 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
FANCAO15360 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
FANCAO15360 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
FANCAO15360 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
FANCAO15360 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms