Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHADO15335 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHADO15335 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHADO15335 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHADO15335 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHADO15335 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHADO15335 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHADO15335 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHADO15335 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHADO15335 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHADO15335 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHADO15335 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHADO15335 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHADO15335 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHADO15335 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHADO15335 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHADO15335 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHADO15335 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHADO15335 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHADO15335 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHADO15335 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHADO15335 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHADO15335 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHADO15335 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHADO15335 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHADO15335 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHADO15335 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CHADO15335 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CHADO15335 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CHADO15335 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHADO15335 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CHADO15335 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHADO15335 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CHADO15335 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CHADO15335 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CHADO15335 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CHADO15335 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHADO15335 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHADO15335 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHADO15335 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHADO15335 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHADO15335 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHADO15335 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHADO15335 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHADO15335 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHADO15335 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHADO15335 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CHADO15335 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHADO15335 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHADO15335 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CHADO15335 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHADO15335 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHADO15335 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CHADO15335 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHADO15335 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHADO15335 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHADO15335 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CHADO15335 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHADO15335 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHADO15335 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHADO15335 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHADO15335 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHADO15335 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CHADO15335 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHADO15335 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHADO15335 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHADO15335 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHADO15335 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHADO15335 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHADO15335 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHADO15335 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHADO15335 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHADO15335 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHADO15335 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHADO15335 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHADO15335 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHADO15335 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHADO15335 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHADO15335 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHADO15335 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CHADO15335 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHADO15335 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHADO15335 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHADO15335 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHADO15335 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHADO15335 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHADO15335 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHADO15335 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHADO15335 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHADO15335 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHADO15335 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHADO15335 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHADO15335 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHADO15335 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHADO15335 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHADO15335 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHADO15335 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHADO15335 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHADO15335 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHADO15335 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms