Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ACOX3O15254 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ACOX3O15254 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACOX3O15254 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ACOX3O15254 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ACOX3O15254 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ACOX3O15254 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ACOX3O15254 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ACOX3O15254 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ACOX3O15254 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACOX3O15254 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ACOX3O15254 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ACOX3O15254 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ACOX3O15254 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACOX3O15254 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACOX3O15254 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACOX3O15254 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ACOX3O15254 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACOX3O15254 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACOX3O15254 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACOX3O15254 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACOX3O15254 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACOX3O15254 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACOX3O15254 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACOX3O15254 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACOX3O15254 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACOX3O15254 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACOX3O15254 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACOX3O15254 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACOX3O15254 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ACOX3O15254 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACOX3O15254 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACOX3O15254 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACOX3O15254 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ACOX3O15254 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ACOX3O15254 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACOX3O15254 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ACOX3O15254 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ACOX3O15254 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACOX3O15254 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACOX3O15254 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ACOX3O15254 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ACOX3O15254 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ACOX3O15254 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACOX3O15254 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ACOX3O15254 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACOX3O15254 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ACOX3O15254 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACOX3O15254 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACOX3O15254 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ACOX3O15254 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ACOX3O15254 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACOX3O15254 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ACOX3O15254 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ACOX3O15254 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ACOX3O15254 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ACOX3O15254 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms