Protein–RNA interactions for Protein: O15085

ARHGEF11, Rho guanine nucleotide exchange factor 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF11O15085 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC47.01■■■■■ 5.12
ARHGEF11O15085 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.01■■■■■ 5.12
ARHGEF11O15085 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC47■■■■■ 5.12
ARHGEF11O15085 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC47■■■■■ 5.11
ARHGEF11O15085 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC47■■■■■ 5.11
ARHGEF11O15085 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47■■■■■ 5.11
ARHGEF11O15085 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47■■■■■ 5.11
ARHGEF11O15085 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC46.99■■■■■ 5.11
ARHGEF11O15085 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.98■■■■■ 5.11
ARHGEF11O15085 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
ARHGEF11O15085 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC46.95■■■■■ 5.11
ARHGEF11O15085 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC46.93■■■■■ 5.1
ARHGEF11O15085 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC46.91■■■■■ 5.1
ARHGEF11O15085 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC46.91■■■■■ 5.1
ARHGEF11O15085 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC46.89■■■■■ 5.1
ARHGEF11O15085 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
ARHGEF11O15085 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.09
ARHGEF11O15085 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC46.84■■■■■ 5.09
ARHGEF11O15085 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
ARHGEF11O15085 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
ARHGEF11O15085 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.74■■■■■ 5.07
ARHGEF11O15085 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC46.73■■■■■ 5.07
ARHGEF11O15085 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC46.72■■■■■ 5.07
ARHGEF11O15085 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
ARHGEF11O15085 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC46.69■■■■■ 5.06
ARHGEF11O15085 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC46.68■■■■■ 5.06
ARHGEF11O15085 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC46.68■■■■■ 5.06
ARHGEF11O15085 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC46.66■■■■■ 5.06
ARHGEF11O15085 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC46.65■■■■■ 5.06
ARHGEF11O15085 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC46.65■■■■■ 5.06
ARHGEF11O15085 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC46.65■■■■■ 5.06
ARHGEF11O15085 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC46.62■■■■■ 5.05
ARHGEF11O15085 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.58■■■■■ 5.05
ARHGEF11O15085 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC46.55■■■■■ 5.04
ARHGEF11O15085 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
ARHGEF11O15085 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.53■■■■■ 5.04
ARHGEF11O15085 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.04
ARHGEF11O15085 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
ARHGEF11O15085 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
ARHGEF11O15085 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.48■■■■■ 5.03
ARHGEF11O15085 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.47■■■■■ 5.03
ARHGEF11O15085 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.47■■■■■ 5.03
ARHGEF11O15085 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.46■■■■■ 5.03
ARHGEF11O15085 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC46.44■■■■■ 5.02
ARHGEF11O15085 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC46.43■■■■■ 5.02
ARHGEF11O15085 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC46.39■■■■■ 5.02
ARHGEF11O15085 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.38■■■■■ 5.02
ARHGEF11O15085 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.37■■■■■ 5.01
ARHGEF11O15085 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC46.35■■■■■ 5.01
ARHGEF11O15085 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC46.33■■■■■ 5.01
ARHGEF11O15085 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC46.31■■■■■ 5
ARHGEF11O15085 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC46.3■■■■■ 5
ARHGEF11O15085 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
ARHGEF11O15085 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
ARHGEF11O15085 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC46.27■■■■■ 5
ARHGEF11O15085 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC46.27■■■■■ 5
ARHGEF11O15085 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 4.99
ARHGEF11O15085 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC46.24■■■■■ 4.99
ARHGEF11O15085 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
ARHGEF11O15085 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC46.22■■■■■ 4.99
ARHGEF11O15085 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
ARHGEF11O15085 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.22■■■■■ 4.99
ARHGEF11O15085 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC46.22■■■■■ 4.99
ARHGEF11O15085 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC46.21■■■■■ 4.99
ARHGEF11O15085 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC46.19■■■■■ 4.99
ARHGEF11O15085 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
ARHGEF11O15085 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
ARHGEF11O15085 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
ARHGEF11O15085 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.13■■■■■ 4.98
ARHGEF11O15085 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC46.11■■■■■ 4.97
ARHGEF11O15085 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
ARHGEF11O15085 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC46.08■■■■■ 4.97
ARHGEF11O15085 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
ARHGEF11O15085 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
ARHGEF11O15085 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC46.02■■■■■ 4.96
ARHGEF11O15085 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC46.01■■■■■ 4.96
ARHGEF11O15085 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC45.99■■■■■ 4.95
ARHGEF11O15085 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
ARHGEF11O15085 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
ARHGEF11O15085 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC45.97■■■■■ 4.95
ARHGEF11O15085 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC45.97■■■■■ 4.95
ARHGEF11O15085 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC45.95■■■■■ 4.95
ARHGEF11O15085 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
ARHGEF11O15085 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
ARHGEF11O15085 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.92■■■■■ 4.94
ARHGEF11O15085 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC45.87■■■■■ 4.93
ARHGEF11O15085 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC45.86■■■■■ 4.93
ARHGEF11O15085 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.85■■■■■ 4.93
ARHGEF11O15085 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC45.84■■■■■ 4.93
ARHGEF11O15085 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.78■■■■■ 4.92
ARHGEF11O15085 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC45.77■■■■■ 4.92
ARHGEF11O15085 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.72■■■■■ 4.91
ARHGEF11O15085 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
ARHGEF11O15085 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.69■■■■■ 4.9
ARHGEF11O15085 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
ARHGEF11O15085 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC45.68■■■■■ 4.9
ARHGEF11O15085 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC45.68■■■■■ 4.9
ARHGEF11O15085 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
ARHGEF11O15085 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC45.65■■■■■ 4.9
ARHGEF11O15085 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC45.64■■■■■ 4.9
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