Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.53■■■■■ 4.72
KDM6BO15054 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC44.51■■■■■ 4.72
KDM6BO15054 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
KDM6BO15054 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.48■■■■■ 4.71
KDM6BO15054 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC44.47■■■■■ 4.71
KDM6BO15054 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC44.47■■■■■ 4.71
KDM6BO15054 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC44.46■■■■■ 4.71
KDM6BO15054 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC44.42■■■■■ 4.7
KDM6BO15054 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC44.42■■■■■ 4.7
KDM6BO15054 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.4■■■■■ 4.7
KDM6BO15054 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC44.37■■■■■ 4.69
KDM6BO15054 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC44.36■■■■■ 4.69
KDM6BO15054 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.33■■■■■ 4.69
KDM6BO15054 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.33■■■■■ 4.69
KDM6BO15054 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC44.32■■■■■ 4.69
KDM6BO15054 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC44.32■■■■■ 4.68
KDM6BO15054 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC44.32■■■■■ 4.68
KDM6BO15054 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC44.32■■■■■ 4.68
KDM6BO15054 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.31■■■■■ 4.68
KDM6BO15054 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC44.31■■■■■ 4.68
KDM6BO15054 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC44.29■■■■■ 4.68
KDM6BO15054 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC44.27■■■■■ 4.68
KDM6BO15054 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC44.26■■■■■ 4.68
KDM6BO15054 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
KDM6BO15054 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC44.24■■■■■ 4.67
KDM6BO15054 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.22■■■■■ 4.67
KDM6BO15054 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC44.22■■■■■ 4.67
KDM6BO15054 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.17■■■■■ 4.66
KDM6BO15054 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
KDM6BO15054 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC44.13■■■■■ 4.65
KDM6BO15054 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
KDM6BO15054 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
KDM6BO15054 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
KDM6BO15054 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
KDM6BO15054 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC44.04■■■■■ 4.64
KDM6BO15054 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC44.04■■■■■ 4.64
KDM6BO15054 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.04■■■■■ 4.64
KDM6BO15054 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC44.03■■■■■ 4.64
KDM6BO15054 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC43.98■■■■■ 4.63
KDM6BO15054 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
KDM6BO15054 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.97■■■■■ 4.63
KDM6BO15054 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
KDM6BO15054 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC43.95■■■■■ 4.63
KDM6BO15054 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
KDM6BO15054 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
KDM6BO15054 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.88■■■■■ 4.61
KDM6BO15054 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
KDM6BO15054 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.85■■■■■ 4.61
KDM6BO15054 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
KDM6BO15054 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
KDM6BO15054 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.8■■■■■ 4.6
KDM6BO15054 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC43.78■■■■■ 4.6
KDM6BO15054 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC43.73■■■■■ 4.59
KDM6BO15054 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
KDM6BO15054 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC43.73■■■■■ 4.59
KDM6BO15054 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
KDM6BO15054 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
KDM6BO15054 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
KDM6BO15054 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC43.7■■■■■ 4.59
KDM6BO15054 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
KDM6BO15054 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
KDM6BO15054 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
KDM6BO15054 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
KDM6BO15054 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
KDM6BO15054 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
KDM6BO15054 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
KDM6BO15054 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
KDM6BO15054 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
KDM6BO15054 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.58
KDM6BO15054 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
KDM6BO15054 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
KDM6BO15054 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
KDM6BO15054 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
KDM6BO15054 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC43.57■■■■■ 4.57
KDM6BO15054 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
KDM6BO15054 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
KDM6BO15054 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
KDM6BO15054 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
KDM6BO15054 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
KDM6BO15054 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
KDM6BO15054 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
KDM6BO15054 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
KDM6BO15054 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.55
KDM6BO15054 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
KDM6BO15054 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
KDM6BO15054 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
KDM6BO15054 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
KDM6BO15054 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
KDM6BO15054 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
KDM6BO15054 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC43.35■■■■■ 4.53
KDM6BO15054 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
KDM6BO15054 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
KDM6BO15054 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
KDM6BO15054 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC43.31■■■■■ 4.52
KDM6BO15054 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
KDM6BO15054 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC43.26■■■■■ 4.52
KDM6BO15054 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC43.24■■■■■ 4.51
KDM6BO15054 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
KDM6BO15054 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
KDM6BO15054 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
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