Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
ZNF646O15015 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZNF646O15015 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
ZNF646O15015 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
ZNF646O15015 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
ZNF646O15015 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
ZNF646O15015 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF646O15015 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
ZNF646O15015 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF646O15015 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF646O15015 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ZNF646O15015 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ZNF646O15015 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ZNF646O15015 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ZNF646O15015 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ZNF646O15015 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ZNF646O15015 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
ZNF646O15015 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ZNF646O15015 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
ZNF646O15015 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ZNF646O15015 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ZNF646O15015 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
ZNF646O15015 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ZNF646O15015 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ZNF646O15015 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
ZNF646O15015 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ZNF646O15015 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZNF646O15015 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZNF646O15015 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ZNF646O15015 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
ZNF646O15015 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ZNF646O15015 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ZNF646O15015 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ZNF646O15015 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
ZNF646O15015 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.79■■■■□ 3
ZNF646O15015 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ZNF646O15015 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ZNF646O15015 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZNF646O15015 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZNF646O15015 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ZNF646O15015 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ZNF646O15015 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZNF646O15015 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ZNF646O15015 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ZNF646O15015 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ZNF646O15015 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
ZNF646O15015 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZNF646O15015 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ZNF646O15015 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ZNF646O15015 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZNF646O15015 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZNF646O15015 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZNF646O15015 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZNF646O15015 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
ZNF646O15015 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ZNF646O15015 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZNF646O15015 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ZNF646O15015 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ZNF646O15015 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ZNF646O15015 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
ZNF646O15015 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ZNF646O15015 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
ZNF646O15015 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ZNF646O15015 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ZNF646O15015 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ZNF646O15015 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ZNF646O15015 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ZNF646O15015 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
ZNF646O15015 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
ZNF646O15015 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ZNF646O15015 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ZNF646O15015 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ZNF646O15015 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ZNF646O15015 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ZNF646O15015 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ZNF646O15015 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ZNF646O15015 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ZNF646O15015 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZNF646O15015 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF646O15015 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF646O15015 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZNF646O15015 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF646O15015 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF646O15015 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF646O15015 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF646O15015 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZNF646O15015 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZNF646O15015 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZNF646O15015 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
ZNF646O15015 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZNF646O15015 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
ZNF646O15015 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF646O15015 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF646O15015 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF646O15015 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF646O15015 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF646O15015 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF646O15015 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF646O15015 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF646O15015 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms