Protein–RNA interactions for Protein: O15013

ARHGEF10, Rho guanine nucleotide exchange factor 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF10O15013 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
ARHGEF10O15013 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC38.79■■■■□ 3.8
ARHGEF10O15013 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
ARHGEF10O15013 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC38.78■■■■□ 3.8
ARHGEF10O15013 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
ARHGEF10O15013 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
ARHGEF10O15013 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
ARHGEF10O15013 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
ARHGEF10O15013 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ARHGEF10O15013 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
ARHGEF10O15013 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
ARHGEF10O15013 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
ARHGEF10O15013 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ARHGEF10O15013 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ARHGEF10O15013 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
ARHGEF10O15013 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
ARHGEF10O15013 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
ARHGEF10O15013 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.77
ARHGEF10O15013 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC38.57■■■■□ 3.77
ARHGEF10O15013 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC38.57■■■■□ 3.77
ARHGEF10O15013 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.76
ARHGEF10O15013 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
ARHGEF10O15013 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
ARHGEF10O15013 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
ARHGEF10O15013 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
ARHGEF10O15013 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
ARHGEF10O15013 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ARHGEF10O15013 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
ARHGEF10O15013 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ARHGEF10O15013 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
ARHGEF10O15013 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
ARHGEF10O15013 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
ARHGEF10O15013 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
ARHGEF10O15013 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ARHGEF10O15013 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
ARHGEF10O15013 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
ARHGEF10O15013 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
ARHGEF10O15013 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ARHGEF10O15013 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ARHGEF10O15013 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
ARHGEF10O15013 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
ARHGEF10O15013 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
ARHGEF10O15013 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
ARHGEF10O15013 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ARHGEF10O15013 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ARHGEF10O15013 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
ARHGEF10O15013 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
ARHGEF10O15013 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
ARHGEF10O15013 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
ARHGEF10O15013 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
ARHGEF10O15013 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC38.2■■■■□ 3.71
ARHGEF10O15013 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
ARHGEF10O15013 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
ARHGEF10O15013 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
ARHGEF10O15013 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
ARHGEF10O15013 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
ARHGEF10O15013 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
ARHGEF10O15013 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
ARHGEF10O15013 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
ARHGEF10O15013 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
ARHGEF10O15013 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
ARHGEF10O15013 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
ARHGEF10O15013 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
ARHGEF10O15013 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC38.11■■■■□ 3.69
ARHGEF10O15013 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC38.1■■■■□ 3.69
ARHGEF10O15013 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
ARHGEF10O15013 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ARHGEF10O15013 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ARHGEF10O15013 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ARHGEF10O15013 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
ARHGEF10O15013 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ARHGEF10O15013 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ARHGEF10O15013 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ARHGEF10O15013 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ARHGEF10O15013 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ARHGEF10O15013 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ARHGEF10O15013 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
ARHGEF10O15013 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ARHGEF10O15013 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
ARHGEF10O15013 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
ARHGEF10O15013 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
ARHGEF10O15013 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ARHGEF10O15013 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
ARHGEF10O15013 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
ARHGEF10O15013 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
ARHGEF10O15013 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ARHGEF10O15013 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
ARHGEF10O15013 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ARHGEF10O15013 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
ARHGEF10O15013 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
ARHGEF10O15013 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ARHGEF10O15013 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ARHGEF10O15013 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
ARHGEF10O15013 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
ARHGEF10O15013 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
ARHGEF10O15013 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
ARHGEF10O15013 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
ARHGEF10O15013 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
ARHGEF10O15013 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
ARHGEF10O15013 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
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