Protein–RNA interactions for Protein: O14646

CHD1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD1O14646 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC47.37■■■■■ 5.17
CHD1O14646 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
CHD1O14646 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC47.35■■■■■ 5.17
CHD1O14646 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.33■■■■■ 5.17
CHD1O14646 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.32■■■■■ 5.17
CHD1O14646 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC47.32■■■■■ 5.17
CHD1O14646 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.31■■■■■ 5.16
CHD1O14646 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
CHD1O14646 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC47.28■■■■■ 5.16
CHD1O14646 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
CHD1O14646 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC47.26■■■■■ 5.16
CHD1O14646 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
CHD1O14646 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC47.23■■■■■ 5.15
CHD1O14646 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
CHD1O14646 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC47.22■■■■■ 5.15
CHD1O14646 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC47.21■■■■■ 5.15
CHD1O14646 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC47.2■■■■■ 5.15
CHD1O14646 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC47.19■■■■■ 5.15
CHD1O14646 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC47.19■■■■■ 5.15
CHD1O14646 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC47.19■■■■■ 5.14
CHD1O14646 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.19■■■■■ 5.14
CHD1O14646 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
CHD1O14646 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC47.14■■■■■ 5.14
CHD1O14646 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC47.13■■■■■ 5.14
CHD1O14646 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.11■■■■■ 5.13
CHD1O14646 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC47.11■■■■■ 5.13
CHD1O14646 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC47.1■■■■■ 5.13
CHD1O14646 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC47.1■■■■■ 5.13
CHD1O14646 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
CHD1O14646 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
CHD1O14646 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
CHD1O14646 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC46.96■■■■■ 5.11
CHD1O14646 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.95■■■■■ 5.11
CHD1O14646 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC46.92■■■■■ 5.1
CHD1O14646 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.91■■■■■ 5.1
CHD1O14646 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC46.88■■■■■ 5.09
CHD1O14646 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
CHD1O14646 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC46.86■■■■■ 5.09
CHD1O14646 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.85■■■■■ 5.09
CHD1O14646 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC46.85■■■■■ 5.09
CHD1O14646 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC46.85■■■■■ 5.09
CHD1O14646 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC46.83■■■■■ 5.09
CHD1O14646 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC46.82■■■■■ 5.09
CHD1O14646 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC46.82■■■■■ 5.09
CHD1O14646 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
CHD1O14646 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC46.77■■■■■ 5.08
CHD1O14646 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.77■■■■■ 5.08
CHD1O14646 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
CHD1O14646 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
CHD1O14646 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.76■■■■■ 5.08
CHD1O14646 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC46.75■■■■■ 5.07
CHD1O14646 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.74■■■■■ 5.07
CHD1O14646 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC46.72■■■■■ 5.07
CHD1O14646 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC46.71■■■■■ 5.07
CHD1O14646 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
CHD1O14646 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
CHD1O14646 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC46.68■■■■■ 5.06
CHD1O14646 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC46.68■■■■■ 5.06
CHD1O14646 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC46.68■■■■■ 5.06
CHD1O14646 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
CHD1O14646 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC46.66■■■■■ 5.06
CHD1O14646 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
CHD1O14646 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
CHD1O14646 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
CHD1O14646 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC46.59■■■■■ 5.05
CHD1O14646 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
CHD1O14646 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.04
CHD1O14646 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.04
CHD1O14646 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC46.57■■■■■ 5.04
CHD1O14646 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC46.56■■■■■ 5.04
CHD1O14646 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
CHD1O14646 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC46.56■■■■■ 5.04
CHD1O14646 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
CHD1O14646 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
CHD1O14646 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC46.51■■■■■ 5.04
CHD1O14646 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC46.51■■■■■ 5.04
CHD1O14646 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC46.51■■■■■ 5.04
CHD1O14646 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC46.48■■■■■ 5.03
CHD1O14646 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
CHD1O14646 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
CHD1O14646 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC46.35■■■■■ 5.01
CHD1O14646 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC46.35■■■■■ 5.01
CHD1O14646 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC46.35■■■■■ 5.01
CHD1O14646 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
CHD1O14646 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC46.35■■■■■ 5.01
CHD1O14646 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
CHD1O14646 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC46.31■■■■■ 5
CHD1O14646 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC46.3■■■■■ 5
CHD1O14646 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC46.29■■■■■ 5
CHD1O14646 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC46.27■■■■■ 5
CHD1O14646 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 5
CHD1O14646 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
CHD1O14646 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
CHD1O14646 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC46.22■■■■■ 4.99
CHD1O14646 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
CHD1O14646 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.2■■■■■ 4.99
CHD1O14646 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC46.17■■■■■ 4.98
CHD1O14646 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC46.16■■■■■ 4.98
CHD1O14646 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.15■■■■■ 4.98
CHD1O14646 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms