Protein–RNA interactions for Protein: O14513

NCKAP5, Nck-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP5O14513 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKAP5O14513 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCKAP5O14513 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCKAP5O14513 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCKAP5O14513 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCKAP5O14513 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCKAP5O14513 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCKAP5O14513 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCKAP5O14513 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCKAP5O14513 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NCKAP5O14513 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCKAP5O14513 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCKAP5O14513 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCKAP5O14513 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCKAP5O14513 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCKAP5O14513 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCKAP5O14513 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NCKAP5O14513 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NCKAP5O14513 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NCKAP5O14513 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCKAP5O14513 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCKAP5O14513 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCKAP5O14513 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCKAP5O14513 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCKAP5O14513 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCKAP5O14513 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCKAP5O14513 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCKAP5O14513 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCKAP5O14513 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCKAP5O14513 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCKAP5O14513 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCKAP5O14513 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCKAP5O14513 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NCKAP5O14513 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
NCKAP5O14513 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
NCKAP5O14513 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NCKAP5O14513 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCKAP5O14513 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCKAP5O14513 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCKAP5O14513 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NCKAP5O14513 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NCKAP5O14513 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCKAP5O14513 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NCKAP5O14513 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCKAP5O14513 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCKAP5O14513 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NCKAP5O14513 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NCKAP5O14513 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NCKAP5O14513 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NCKAP5O14513 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NCKAP5O14513 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCKAP5O14513 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NCKAP5O14513 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCKAP5O14513 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NCKAP5O14513 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCKAP5O14513 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NCKAP5O14513 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NCKAP5O14513 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NCKAP5O14513 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCKAP5O14513 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NCKAP5O14513 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NCKAP5O14513 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCKAP5O14513 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCKAP5O14513 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCKAP5O14513 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCKAP5O14513 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NCKAP5O14513 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCKAP5O14513 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCKAP5O14513 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NCKAP5O14513 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCKAP5O14513 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NCKAP5O14513 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCKAP5O14513 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCKAP5O14513 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCKAP5O14513 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
NCKAP5O14513 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
NCKAP5O14513 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCKAP5O14513 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NCKAP5O14513 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NCKAP5O14513 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NCKAP5O14513 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
NCKAP5O14513 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NCKAP5O14513 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
NCKAP5O14513 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKAP5O14513 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKAP5O14513 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NCKAP5O14513 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCKAP5O14513 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NCKAP5O14513 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NCKAP5O14513 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NCKAP5O14513 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCKAP5O14513 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NCKAP5O14513 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCKAP5O14513 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NCKAP5O14513 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKAP5O14513 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKAP5O14513 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKAP5O14513 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NCKAP5O14513 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NCKAP5O14513 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms