Protein–RNA interactions for Protein: O00253

AGRP, Agouti-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRPO00253 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AGRPO00253 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AGRPO00253 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
AGRPO00253 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AGRPO00253 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AGRPO00253 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AGRPO00253 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AGRPO00253 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
AGRPO00253 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AGRPO00253 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
AGRPO00253 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
AGRPO00253 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
AGRPO00253 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AGRPO00253 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
AGRPO00253 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AGRPO00253 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
AGRPO00253 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
AGRPO00253 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AGRPO00253 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
AGRPO00253 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
AGRPO00253 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AGRPO00253 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
AGRPO00253 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
AGRPO00253 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
AGRPO00253 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AGRPO00253 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
AGRPO00253 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AGRPO00253 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
AGRPO00253 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
AGRPO00253 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AGRPO00253 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
AGRPO00253 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGRPO00253 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AGRPO00253 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AGRPO00253 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AGRPO00253 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AGRPO00253 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AGRPO00253 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
AGRPO00253 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AGRPO00253 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGRPO00253 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
AGRPO00253 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AGRPO00253 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AGRPO00253 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AGRPO00253 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AGRPO00253 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AGRPO00253 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AGRPO00253 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AGRPO00253 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AGRPO00253 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AGRPO00253 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AGRPO00253 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AGRPO00253 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AGRPO00253 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AGRPO00253 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AGRPO00253 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
AGRPO00253 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AGRPO00253 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
AGRPO00253 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AGRPO00253 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
AGRPO00253 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AGRPO00253 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AGRPO00253 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGRPO00253 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGRPO00253 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGRPO00253 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGRPO00253 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AGRPO00253 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AGRPO00253 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AGRPO00253 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AGRPO00253 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AGRPO00253 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AGRPO00253 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AGRPO00253 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AGRPO00253 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AGRPO00253 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
AGRPO00253 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AGRPO00253 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AGRPO00253 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AGRPO00253 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AGRPO00253 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
AGRPO00253 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AGRPO00253 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
AGRPO00253 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
AGRPO00253 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AGRPO00253 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AGRPO00253 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AGRPO00253 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGRPO00253 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGRPO00253 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AGRPO00253 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AGRPO00253 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AGRPO00253 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AGRPO00253 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AGRPO00253 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AGRPO00253 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AGRPO00253 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
AGRPO00253 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
AGRPO00253 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
AGRPO00253 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms