Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMD12O00232 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMD12O00232 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMD12O00232 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMD12O00232 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMD12O00232 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMD12O00232 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMD12O00232 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMD12O00232 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMD12O00232 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMD12O00232 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMD12O00232 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PSMD12O00232 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD12O00232 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PSMD12O00232 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD12O00232 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD12O00232 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD12O00232 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD12O00232 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD12O00232 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD12O00232 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD12O00232 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PSMD12O00232 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PSMD12O00232 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMD12O00232 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PSMD12O00232 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PSMD12O00232 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD12O00232 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PSMD12O00232 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PSMD12O00232 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PSMD12O00232 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMD12O00232 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PSMD12O00232 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMD12O00232 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMD12O00232 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMD12O00232 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMD12O00232 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PSMD12O00232 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PSMD12O00232 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMD12O00232 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMD12O00232 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PSMD12O00232 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMD12O00232 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PSMD12O00232 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PSMD12O00232 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PSMD12O00232 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMD12O00232 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PSMD12O00232 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD12O00232 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PSMD12O00232 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD12O00232 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PSMD12O00232 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PSMD12O00232 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PSMD12O00232 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PSMD12O00232 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMD12O00232 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PSMD12O00232 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PSMD12O00232 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMD12O00232 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PSMD12O00232 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PSMD12O00232 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PSMD12O00232 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD12O00232 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PSMD12O00232 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMD12O00232 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMD12O00232 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMD12O00232 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PSMD12O00232 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMD12O00232 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PSMD12O00232 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PSMD12O00232 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMD12O00232 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PSMD12O00232 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PSMD12O00232 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
PSMD12O00232 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PSMD12O00232 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMD12O00232 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMD12O00232 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PSMD12O00232 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD12O00232 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD12O00232 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD12O00232 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PSMD12O00232 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMD12O00232 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PSMD12O00232 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD12O00232 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD12O00232 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PSMD12O00232 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PSMD12O00232 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMD12O00232 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMD12O00232 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PSMD12O00232 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PSMD12O00232 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PSMD12O00232 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD12O00232 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD12O00232 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PSMD12O00232 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD12O00232 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD12O00232 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PSMD12O00232 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms