Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SMAPO00193 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMAPO00193 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMAPO00193 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMAPO00193 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMAPO00193 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMAPO00193 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMAPO00193 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMAPO00193 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMAPO00193 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMAPO00193 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMAPO00193 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMAPO00193 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMAPO00193 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMAPO00193 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMAPO00193 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMAPO00193 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMAPO00193 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMAPO00193 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMAPO00193 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMAPO00193 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMAPO00193 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SMAPO00193 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMAPO00193 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SMAPO00193 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMAPO00193 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMAPO00193 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SMAPO00193 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMAPO00193 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMAPO00193 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMAPO00193 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SMAPO00193 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMAPO00193 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMAPO00193 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMAPO00193 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMAPO00193 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMAPO00193 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMAPO00193 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMAPO00193 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMAPO00193 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMAPO00193 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMAPO00193 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMAPO00193 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMAPO00193 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMAPO00193 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMAPO00193 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMAPO00193 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMAPO00193 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMAPO00193 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMAPO00193 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMAPO00193 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMAPO00193 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMAPO00193 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMAPO00193 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMAPO00193 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMAPO00193 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMAPO00193 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMAPO00193 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMAPO00193 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMAPO00193 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMAPO00193 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMAPO00193 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMAPO00193 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMAPO00193 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMAPO00193 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMAPO00193 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMAPO00193 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMAPO00193 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMAPO00193 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMAPO00193 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMAPO00193 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SMAPO00193 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMAPO00193 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMAPO00193 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMAPO00193 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMAPO00193 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMAPO00193 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMAPO00193 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SMAPO00193 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMAPO00193 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SMAPO00193 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SMAPO00193 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SMAPO00193 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SMAPO00193 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMAPO00193 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SMAPO00193 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMAPO00193 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SMAPO00193 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SMAPO00193 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SMAPO00193 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SMAPO00193 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
SMAPO00193 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMAPO00193 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SMAPO00193 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMAPO00193 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SMAPO00193 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SMAPO00193 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMAPO00193 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SMAPO00193 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
SMAPO00193 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
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