Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
SNAP23O00161 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SNAP23O00161 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SNAP23O00161 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
SNAP23O00161 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SNAP23O00161 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
SNAP23O00161 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
SNAP23O00161 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
SNAP23O00161 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
SNAP23O00161 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
SNAP23O00161 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
SNAP23O00161 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SNAP23O00161 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
SNAP23O00161 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SNAP23O00161 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
SNAP23O00161 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
SNAP23O00161 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SNAP23O00161 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
SNAP23O00161 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SNAP23O00161 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
SNAP23O00161 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
SNAP23O00161 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
SNAP23O00161 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
SNAP23O00161 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
SNAP23O00161 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SNAP23O00161 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
SNAP23O00161 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SNAP23O00161 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SNAP23O00161 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SNAP23O00161 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SNAP23O00161 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
SNAP23O00161 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SNAP23O00161 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SNAP23O00161 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SNAP23O00161 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SNAP23O00161 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SNAP23O00161 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SNAP23O00161 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SNAP23O00161 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SNAP23O00161 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SNAP23O00161 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SNAP23O00161 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
SNAP23O00161 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
SNAP23O00161 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
SNAP23O00161 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
SNAP23O00161 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
SNAP23O00161 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
SNAP23O00161 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
SNAP23O00161 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
SNAP23O00161 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SNAP23O00161 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SNAP23O00161 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SNAP23O00161 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SNAP23O00161 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
SNAP23O00161 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SNAP23O00161 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
SNAP23O00161 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SNAP23O00161 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
SNAP23O00161 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
SNAP23O00161 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
SNAP23O00161 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SNAP23O00161 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SNAP23O00161 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
SNAP23O00161 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
SNAP23O00161 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SNAP23O00161 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
SNAP23O00161 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SNAP23O00161 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
SNAP23O00161 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
SNAP23O00161 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SNAP23O00161 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
SNAP23O00161 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SNAP23O00161 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
SNAP23O00161 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
SNAP23O00161 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SNAP23O00161 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SNAP23O00161 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SNAP23O00161 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SNAP23O00161 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
SNAP23O00161 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
SNAP23O00161 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SNAP23O00161 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SNAP23O00161 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SNAP23O00161 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SNAP23O00161 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SNAP23O00161 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
SNAP23O00161 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
SNAP23O00161 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SNAP23O00161 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SNAP23O00161 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
SNAP23O00161 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
SNAP23O00161 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SNAP23O00161 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SNAP23O00161 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SNAP23O00161 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SNAP23O00161 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
SNAP23O00161 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SNAP23O00161 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SNAP23O00161 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
SNAP23O00161 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms