Protein–RNA interactions for Protein: H3BPM6

MKRN2OS, MKRN2 opposite strand protein, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2OSH3BPM6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKRN2OSH3BPM6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKRN2OSH3BPM6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MKRN2OSH3BPM6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MKRN2OSH3BPM6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MKRN2OSH3BPM6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN2OSH3BPM6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN2OSH3BPM6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MKRN2OSH3BPM6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MKRN2OSH3BPM6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MKRN2OSH3BPM6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN2OSH3BPM6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN2OSH3BPM6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MKRN2OSH3BPM6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKRN2OSH3BPM6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKRN2OSH3BPM6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKRN2OSH3BPM6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MKRN2OSH3BPM6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MKRN2OSH3BPM6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
MKRN2OSH3BPM6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN2OSH3BPM6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN2OSH3BPM6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN2OSH3BPM6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MKRN2OSH3BPM6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN2OSH3BPM6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN2OSH3BPM6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MKRN2OSH3BPM6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKRN2OSH3BPM6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MKRN2OSH3BPM6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKRN2OSH3BPM6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MKRN2OSH3BPM6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKRN2OSH3BPM6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MKRN2OSH3BPM6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MKRN2OSH3BPM6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MKRN2OSH3BPM6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MKRN2OSH3BPM6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MKRN2OSH3BPM6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MKRN2OSH3BPM6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MKRN2OSH3BPM6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN2OSH3BPM6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MKRN2OSH3BPM6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MKRN2OSH3BPM6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN2OSH3BPM6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN2OSH3BPM6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MKRN2OSH3BPM6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
MKRN2OSH3BPM6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN2OSH3BPM6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MKRN2OSH3BPM6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MKRN2OSH3BPM6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN2OSH3BPM6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN2OSH3BPM6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MKRN2OSH3BPM6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MKRN2OSH3BPM6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MKRN2OSH3BPM6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MKRN2OSH3BPM6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKRN2OSH3BPM6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MKRN2OSH3BPM6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MKRN2OSH3BPM6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKRN2OSH3BPM6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MKRN2OSH3BPM6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MKRN2OSH3BPM6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MKRN2OSH3BPM6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN2OSH3BPM6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN2OSH3BPM6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MKRN2OSH3BPM6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN2OSH3BPM6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MKRN2OSH3BPM6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MKRN2OSH3BPM6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKRN2OSH3BPM6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MKRN2OSH3BPM6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKRN2OSH3BPM6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MKRN2OSH3BPM6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN2OSH3BPM6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN2OSH3BPM6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN2OSH3BPM6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN2OSH3BPM6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MKRN2OSH3BPM6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MKRN2OSH3BPM6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN2OSH3BPM6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MKRN2OSH3BPM6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKRN2OSH3BPM6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MKRN2OSH3BPM6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MKRN2OSH3BPM6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN2OSH3BPM6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN2OSH3BPM6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MKRN2OSH3BPM6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN2OSH3BPM6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN2OSH3BPM6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MKRN2OSH3BPM6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN2OSH3BPM6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MKRN2OSH3BPM6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKRN2OSH3BPM6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MKRN2OSH3BPM6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKRN2OSH3BPM6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKRN2OSH3BPM6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MKRN2OSH3BPM6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MKRN2OSH3BPM6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MKRN2OSH3BPM6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
MKRN2OSH3BPM6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MKRN2OSH3BPM6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms