Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC2LH3BP13 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAPPC2LH3BP13 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC2LH3BP13 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAPPC2LH3BP13 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAPPC2LH3BP13 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAPPC2LH3BP13 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAPPC2LH3BP13 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC2LH3BP13 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAPPC2LH3BP13 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC2LH3BP13 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC2LH3BP13 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC2LH3BP13 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAPPC2LH3BP13 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC2LH3BP13 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAPPC2LH3BP13 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAPPC2LH3BP13 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC2LH3BP13 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC2LH3BP13 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC2LH3BP13 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRAPPC2LH3BP13 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRAPPC2LH3BP13 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRAPPC2LH3BP13 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRAPPC2LH3BP13 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC2LH3BP13 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRAPPC2LH3BP13 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRAPPC2LH3BP13 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRAPPC2LH3BP13 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC2LH3BP13 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRAPPC2LH3BP13 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRAPPC2LH3BP13 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC2LH3BP13 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC2LH3BP13 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC2LH3BP13 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRAPPC2LH3BP13 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC2LH3BP13 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRAPPC2LH3BP13 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC2LH3BP13 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC2LH3BP13 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRAPPC2LH3BP13 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC2LH3BP13 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC2LH3BP13 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRAPPC2LH3BP13 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC2LH3BP13 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC2LH3BP13 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC2LH3BP13 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TRAPPC2LH3BP13 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC2LH3BP13 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC2LH3BP13 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TRAPPC2LH3BP13 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC2LH3BP13 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC2LH3BP13 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC2LH3BP13 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC2LH3BP13 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TRAPPC2LH3BP13 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC2LH3BP13 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC2LH3BP13 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRAPPC2LH3BP13 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRAPPC2LH3BP13 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC2LH3BP13 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC2LH3BP13 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAPPC2LH3BP13 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC2LH3BP13 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC2LH3BP13 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC2LH3BP13 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAPPC2LH3BP13 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC2LH3BP13 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC2LH3BP13 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC2LH3BP13 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAPPC2LH3BP13 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAPPC2LH3BP13 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAPPC2LH3BP13 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC2LH3BP13 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAPPC2LH3BP13 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAPPC2LH3BP13 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC2LH3BP13 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC2LH3BP13 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAPPC2LH3BP13 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC2LH3BP13 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC2LH3BP13 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC2LH3BP13 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC2LH3BP13 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAPPC2LH3BP13 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRAPPC2LH3BP13 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC2LH3BP13 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC2LH3BP13 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC2LH3BP13 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRAPPC2LH3BP13 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRAPPC2LH3BP13 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC2LH3BP13 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRAPPC2LH3BP13 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC2LH3BP13 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC2LH3BP13 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC2LH3BP13 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC2LH3BP13 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRAPPC2LH3BP13 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC2LH3BP13 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC2LH3BP13 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRAPPC2LH3BP13 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC2LH3BP13 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms