Protein–RNA interactions for Protein: H3BM21

Integrin beta (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BM21 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
H3BM21 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
H3BM21 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
H3BM21 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
H3BM21 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
H3BM21 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
H3BM21 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
H3BM21 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
H3BM21 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
H3BM21 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
H3BM21 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
H3BM21 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
H3BM21 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H3BM21 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H3BM21 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
H3BM21 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
H3BM21 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
H3BM21 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
H3BM21 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
H3BM21 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
H3BM21 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
H3BM21 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H3BM21 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
H3BM21 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
H3BM21 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
H3BM21 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
H3BM21 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
H3BM21 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
H3BM21 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
H3BM21 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
H3BM21 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
H3BM21 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
H3BM21 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
H3BM21 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
H3BM21 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
H3BM21 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
H3BM21 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
H3BM21 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
H3BM21 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
H3BM21 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
H3BM21 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
H3BM21 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
H3BM21 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
H3BM21 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
H3BM21 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
H3BM21 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
H3BM21 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
H3BM21 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
H3BM21 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
H3BM21 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
H3BM21 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
H3BM21 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
H3BM21 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
H3BM21 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
H3BM21 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
H3BM21 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
H3BM21 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
H3BM21 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
H3BM21 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
H3BM21 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
H3BM21 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
H3BM21 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H3BM21 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
H3BM21 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
H3BM21 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
H3BM21 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
H3BM21 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
H3BM21 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
H3BM21 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
H3BM21 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
H3BM21 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
H3BM21 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
H3BM21 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
H3BM21 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
H3BM21 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
H3BM21 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
H3BM21 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
H3BM21 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
H3BM21 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
H3BM21 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
H3BM21 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
H3BM21 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
H3BM21 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
H3BM21 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
H3BM21 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
H3BM21 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
H3BM21 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
H3BM21 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H3BM21 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
H3BM21 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
H3BM21 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
H3BM21 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
H3BM21 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
H3BM21 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
H3BM21 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
H3BM21 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
H3BM21 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
H3BM21 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
H3BM21 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
H3BM21 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms