Protein–RNA interactions for Protein: F8WFD2

NPIPA3, Nuclear pore complex-interacting protein family member A3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA3F8WFD2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPIPA3F8WFD2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPIPA3F8WFD2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPIPA3F8WFD2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NPIPA3F8WFD2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPIPA3F8WFD2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPIPA3F8WFD2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NPIPA3F8WFD2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NPIPA3F8WFD2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPIPA3F8WFD2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPIPA3F8WFD2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NPIPA3F8WFD2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NPIPA3F8WFD2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPIPA3F8WFD2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NPIPA3F8WFD2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPIPA3F8WFD2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NPIPA3F8WFD2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPIPA3F8WFD2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPIPA3F8WFD2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPIPA3F8WFD2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPIPA3F8WFD2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NPIPA3F8WFD2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NPIPA3F8WFD2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPIPA3F8WFD2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NPIPA3F8WFD2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPIPA3F8WFD2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NPIPA3F8WFD2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPIPA3F8WFD2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPIPA3F8WFD2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPIPA3F8WFD2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPIPA3F8WFD2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NPIPA3F8WFD2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPIPA3F8WFD2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NPIPA3F8WFD2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPIPA3F8WFD2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPIPA3F8WFD2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPIPA3F8WFD2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NPIPA3F8WFD2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NPIPA3F8WFD2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPIPA3F8WFD2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NPIPA3F8WFD2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NPIPA3F8WFD2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPIPA3F8WFD2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPIPA3F8WFD2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPIPA3F8WFD2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPIPA3F8WFD2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25■■□□□ 1.59
NPIPA3F8WFD2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPIPA3F8WFD2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPIPA3F8WFD2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPIPA3F8WFD2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NPIPA3F8WFD2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPIPA3F8WFD2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPIPA3F8WFD2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPIPA3F8WFD2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPIPA3F8WFD2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPIPA3F8WFD2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NPIPA3F8WFD2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NPIPA3F8WFD2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NPIPA3F8WFD2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPIPA3F8WFD2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPIPA3F8WFD2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NPIPA3F8WFD2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NPIPA3F8WFD2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPIPA3F8WFD2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NPIPA3F8WFD2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPIPA3F8WFD2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPIPA3F8WFD2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
NPIPA3F8WFD2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NPIPA3F8WFD2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
NPIPA3F8WFD2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPIPA3F8WFD2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NPIPA3F8WFD2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NPIPA3F8WFD2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPIPA3F8WFD2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPIPA3F8WFD2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NPIPA3F8WFD2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NPIPA3F8WFD2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPIPA3F8WFD2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NPIPA3F8WFD2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPIPA3F8WFD2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NPIPA3F8WFD2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NPIPA3F8WFD2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NPIPA3F8WFD2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPIPA3F8WFD2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NPIPA3F8WFD2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NPIPA3F8WFD2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPIPA3F8WFD2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NPIPA3F8WFD2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPIPA3F8WFD2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPIPA3F8WFD2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPIPA3F8WFD2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPIPA3F8WFD2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NPIPA3F8WFD2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPIPA3F8WFD2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NPIPA3F8WFD2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPIPA3F8WFD2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPIPA3F8WFD2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPIPA3F8WFD2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPIPA3F8WFD2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NPIPA3F8WFD2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms