Protein–RNA interactions for Protein: E7EW31

PROB1, Proline-rich basic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROB1E7EW31 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PROB1E7EW31 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PROB1E7EW31 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PROB1E7EW31 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PROB1E7EW31 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PROB1E7EW31 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PROB1E7EW31 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PROB1E7EW31 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PROB1E7EW31 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PROB1E7EW31 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PROB1E7EW31 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PROB1E7EW31 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PROB1E7EW31 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PROB1E7EW31 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PROB1E7EW31 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PROB1E7EW31 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PROB1E7EW31 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PROB1E7EW31 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PROB1E7EW31 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PROB1E7EW31 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PROB1E7EW31 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PROB1E7EW31 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PROB1E7EW31 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PROB1E7EW31 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PROB1E7EW31 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PROB1E7EW31 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PROB1E7EW31 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PROB1E7EW31 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PROB1E7EW31 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PROB1E7EW31 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PROB1E7EW31 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
PROB1E7EW31 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PROB1E7EW31 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PROB1E7EW31 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PROB1E7EW31 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PROB1E7EW31 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PROB1E7EW31 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PROB1E7EW31 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PROB1E7EW31 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PROB1E7EW31 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PROB1E7EW31 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PROB1E7EW31 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PROB1E7EW31 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PROB1E7EW31 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PROB1E7EW31 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PROB1E7EW31 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PROB1E7EW31 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PROB1E7EW31 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PROB1E7EW31 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PROB1E7EW31 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PROB1E7EW31 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PROB1E7EW31 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PROB1E7EW31 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PROB1E7EW31 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PROB1E7EW31 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PROB1E7EW31 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PROB1E7EW31 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PROB1E7EW31 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PROB1E7EW31 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PROB1E7EW31 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PROB1E7EW31 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PROB1E7EW31 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PROB1E7EW31 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROB1E7EW31 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PROB1E7EW31 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PROB1E7EW31 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PROB1E7EW31 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PROB1E7EW31 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PROB1E7EW31 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PROB1E7EW31 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PROB1E7EW31 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PROB1E7EW31 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PROB1E7EW31 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PROB1E7EW31 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PROB1E7EW31 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PROB1E7EW31 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PROB1E7EW31 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PROB1E7EW31 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PROB1E7EW31 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PROB1E7EW31 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PROB1E7EW31 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PROB1E7EW31 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PROB1E7EW31 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PROB1E7EW31 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PROB1E7EW31 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PROB1E7EW31 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PROB1E7EW31 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PROB1E7EW31 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PROB1E7EW31 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PROB1E7EW31 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PROB1E7EW31 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PROB1E7EW31 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PROB1E7EW31 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PROB1E7EW31 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PROB1E7EW31 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PROB1E7EW31 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PROB1E7EW31 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PROB1E7EW31 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PROB1E7EW31 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PROB1E7EW31 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms