Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP99D6REC4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CFAP99D6REC4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP99D6REC4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CFAP99D6REC4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP99D6REC4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CFAP99D6REC4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP99D6REC4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CFAP99D6REC4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP99D6REC4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CFAP99D6REC4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP99D6REC4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP99D6REC4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP99D6REC4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP99D6REC4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP99D6REC4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP99D6REC4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CFAP99D6REC4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CFAP99D6REC4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP99D6REC4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP99D6REC4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP99D6REC4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP99D6REC4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP99D6REC4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CFAP99D6REC4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP99D6REC4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP99D6REC4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP99D6REC4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CFAP99D6REC4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CFAP99D6REC4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP99D6REC4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP99D6REC4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP99D6REC4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP99D6REC4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CFAP99D6REC4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP99D6REC4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP99D6REC4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CFAP99D6REC4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CFAP99D6REC4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CFAP99D6REC4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CFAP99D6REC4 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFAP99D6REC4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFAP99D6REC4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFAP99D6REC4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CFAP99D6REC4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP99D6REC4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP99D6REC4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP99D6REC4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFAP99D6REC4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP99D6REC4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP99D6REC4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP99D6REC4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP99D6REC4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP99D6REC4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP99D6REC4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CFAP99D6REC4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP99D6REC4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP99D6REC4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CFAP99D6REC4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CFAP99D6REC4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP99D6REC4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP99D6REC4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP99D6REC4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP99D6REC4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CFAP99D6REC4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP99D6REC4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CFAP99D6REC4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP99D6REC4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP99D6REC4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP99D6REC4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP99D6REC4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP99D6REC4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP99D6REC4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP99D6REC4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CFAP99D6REC4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP99D6REC4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP99D6REC4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP99D6REC4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFAP99D6REC4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFAP99D6REC4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP99D6REC4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP99D6REC4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP99D6REC4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP99D6REC4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP99D6REC4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP99D6REC4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP99D6REC4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP99D6REC4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP99D6REC4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP99D6REC4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP99D6REC4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP99D6REC4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP99D6REC4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP99D6REC4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP99D6REC4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CFAP99D6REC4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP99D6REC4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CFAP99D6REC4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CFAP99D6REC4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP99D6REC4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms