Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DEV8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DEV8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
B4DEV8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
B4DEV8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
B4DEV8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
B4DEV8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
B4DEV8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
B4DEV8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
B4DEV8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
B4DEV8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
B4DEV8 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
B4DEV8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
B4DEV8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
B4DEV8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
B4DEV8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
B4DEV8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
B4DEV8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
B4DEV8 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
B4DEV8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
B4DEV8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
B4DEV8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
B4DEV8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
B4DEV8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
B4DEV8 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4DEV8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
B4DEV8 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
B4DEV8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DEV8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
B4DEV8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
B4DEV8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
B4DEV8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DEV8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DEV8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
B4DEV8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4DEV8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
B4DEV8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
B4DEV8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
B4DEV8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DEV8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
B4DEV8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DEV8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DEV8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DEV8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DEV8 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DEV8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
B4DEV8 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
B4DEV8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DEV8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DEV8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
B4DEV8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4DEV8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
B4DEV8 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
B4DEV8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
B4DEV8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
B4DEV8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DEV8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DEV8 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DEV8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DEV8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
B4DEV8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DEV8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DEV8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DEV8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DEV8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DEV8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
B4DEV8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
B4DEV8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DEV8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
B4DEV8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DEV8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
B4DEV8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
B4DEV8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4DEV8 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4DEV8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
B4DEV8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DEV8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
B4DEV8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
B4DEV8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
B4DEV8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4DEV8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
B4DEV8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DEV8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
B4DEV8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4DEV8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4DEV8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4DEV8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
B4DEV8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
B4DEV8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DEV8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DEV8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DEV8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DEV8 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DEV8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
B4DEV8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DEV8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
B4DEV8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
B4DEV8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
B4DEV8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
B4DEV8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms