Protein–RNA interactions for Protein: A6NGB9

WIPF3, WAS/WASL-interacting protein family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WIPF3A6NGB9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
WIPF3A6NGB9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WIPF3A6NGB9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
WIPF3A6NGB9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
WIPF3A6NGB9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
WIPF3A6NGB9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WIPF3A6NGB9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
WIPF3A6NGB9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
WIPF3A6NGB9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WIPF3A6NGB9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
WIPF3A6NGB9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
WIPF3A6NGB9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
WIPF3A6NGB9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
WIPF3A6NGB9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
WIPF3A6NGB9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WIPF3A6NGB9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
WIPF3A6NGB9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
WIPF3A6NGB9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
WIPF3A6NGB9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
WIPF3A6NGB9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
WIPF3A6NGB9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
WIPF3A6NGB9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
WIPF3A6NGB9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
WIPF3A6NGB9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WIPF3A6NGB9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
WIPF3A6NGB9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
WIPF3A6NGB9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WIPF3A6NGB9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
WIPF3A6NGB9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
WIPF3A6NGB9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
WIPF3A6NGB9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WIPF3A6NGB9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
WIPF3A6NGB9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
WIPF3A6NGB9 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
WIPF3A6NGB9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
WIPF3A6NGB9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
WIPF3A6NGB9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
WIPF3A6NGB9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WIPF3A6NGB9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
WIPF3A6NGB9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
WIPF3A6NGB9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
WIPF3A6NGB9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WIPF3A6NGB9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WIPF3A6NGB9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
WIPF3A6NGB9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
WIPF3A6NGB9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
WIPF3A6NGB9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
WIPF3A6NGB9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
WIPF3A6NGB9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
WIPF3A6NGB9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
WIPF3A6NGB9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
WIPF3A6NGB9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
WIPF3A6NGB9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
WIPF3A6NGB9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
WIPF3A6NGB9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
WIPF3A6NGB9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
WIPF3A6NGB9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
WIPF3A6NGB9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
WIPF3A6NGB9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
WIPF3A6NGB9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
WIPF3A6NGB9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
WIPF3A6NGB9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WIPF3A6NGB9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
WIPF3A6NGB9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
WIPF3A6NGB9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WIPF3A6NGB9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
WIPF3A6NGB9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
WIPF3A6NGB9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
WIPF3A6NGB9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
WIPF3A6NGB9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
WIPF3A6NGB9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
WIPF3A6NGB9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
WIPF3A6NGB9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
WIPF3A6NGB9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
WIPF3A6NGB9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
WIPF3A6NGB9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
WIPF3A6NGB9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
WIPF3A6NGB9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WIPF3A6NGB9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WIPF3A6NGB9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
WIPF3A6NGB9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
WIPF3A6NGB9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WIPF3A6NGB9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
WIPF3A6NGB9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WIPF3A6NGB9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
WIPF3A6NGB9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
WIPF3A6NGB9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
WIPF3A6NGB9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
WIPF3A6NGB9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
WIPF3A6NGB9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WIPF3A6NGB9 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WIPF3A6NGB9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WIPF3A6NGB9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WIPF3A6NGB9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WIPF3A6NGB9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
WIPF3A6NGB9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
WIPF3A6NGB9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WIPF3A6NGB9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WIPF3A6NGB9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WIPF3A6NGB9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms