Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP73A6NFT4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CFAP73A6NFT4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CFAP73A6NFT4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP73A6NFT4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CFAP73A6NFT4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP73A6NFT4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CFAP73A6NFT4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP73A6NFT4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP73A6NFT4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CFAP73A6NFT4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP73A6NFT4 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP73A6NFT4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP73A6NFT4 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP73A6NFT4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CFAP73A6NFT4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP73A6NFT4 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP73A6NFT4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP73A6NFT4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CFAP73A6NFT4 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CFAP73A6NFT4 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP73A6NFT4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CFAP73A6NFT4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP73A6NFT4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CFAP73A6NFT4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CFAP73A6NFT4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFAP73A6NFT4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CFAP73A6NFT4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFAP73A6NFT4 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CFAP73A6NFT4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFAP73A6NFT4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFAP73A6NFT4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CFAP73A6NFT4 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP73A6NFT4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CFAP73A6NFT4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CFAP73A6NFT4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CFAP73A6NFT4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CFAP73A6NFT4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP73A6NFT4 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP73A6NFT4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CFAP73A6NFT4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP73A6NFT4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CFAP73A6NFT4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP73A6NFT4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CFAP73A6NFT4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP73A6NFT4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP73A6NFT4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP73A6NFT4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP73A6NFT4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CFAP73A6NFT4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CFAP73A6NFT4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CFAP73A6NFT4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CFAP73A6NFT4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP73A6NFT4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CFAP73A6NFT4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CFAP73A6NFT4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP73A6NFT4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP73A6NFT4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CFAP73A6NFT4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFAP73A6NFT4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFAP73A6NFT4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CFAP73A6NFT4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFAP73A6NFT4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CFAP73A6NFT4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CFAP73A6NFT4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP73A6NFT4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CFAP73A6NFT4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CFAP73A6NFT4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP73A6NFT4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CFAP73A6NFT4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP73A6NFT4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CFAP73A6NFT4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP73A6NFT4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP73A6NFT4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CFAP73A6NFT4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP73A6NFT4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CFAP73A6NFT4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP73A6NFT4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CFAP73A6NFT4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CFAP73A6NFT4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CFAP73A6NFT4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP73A6NFT4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CFAP73A6NFT4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CFAP73A6NFT4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP73A6NFT4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP73A6NFT4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP73A6NFT4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CFAP73A6NFT4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CFAP73A6NFT4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CFAP73A6NFT4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP73A6NFT4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CFAP73A6NFT4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CFAP73A6NFT4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP73A6NFT4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP73A6NFT4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CFAP73A6NFT4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP73A6NFT4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CFAP73A6NFT4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP73A6NFT4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CFAP73A6NFT4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms