Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM247A6NEH6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMEM247A6NEH6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMEM247A6NEH6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM247A6NEH6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM247A6NEH6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM247A6NEH6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM247A6NEH6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM247A6NEH6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM247A6NEH6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM247A6NEH6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM247A6NEH6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM247A6NEH6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM247A6NEH6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM247A6NEH6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM247A6NEH6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM247A6NEH6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM247A6NEH6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM247A6NEH6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM247A6NEH6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM247A6NEH6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM247A6NEH6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM247A6NEH6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM247A6NEH6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM247A6NEH6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM247A6NEH6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM247A6NEH6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM247A6NEH6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM247A6NEH6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM247A6NEH6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMEM247A6NEH6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM247A6NEH6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM247A6NEH6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM247A6NEH6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM247A6NEH6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM247A6NEH6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM247A6NEH6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM247A6NEH6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM247A6NEH6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM247A6NEH6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM247A6NEH6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM247A6NEH6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM247A6NEH6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM247A6NEH6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM247A6NEH6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM247A6NEH6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM247A6NEH6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM247A6NEH6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM247A6NEH6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM247A6NEH6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM247A6NEH6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM247A6NEH6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM247A6NEH6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMEM247A6NEH6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMEM247A6NEH6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM247A6NEH6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMEM247A6NEH6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TMEM247A6NEH6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMEM247A6NEH6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM247A6NEH6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMEM247A6NEH6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMEM247A6NEH6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM247A6NEH6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMEM247A6NEH6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMEM247A6NEH6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
TMEM247A6NEH6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMEM247A6NEH6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM247A6NEH6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMEM247A6NEH6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMEM247A6NEH6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMEM247A6NEH6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM247A6NEH6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMEM247A6NEH6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
TMEM247A6NEH6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM247A6NEH6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM247A6NEH6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM247A6NEH6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TMEM247A6NEH6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TMEM247A6NEH6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM247A6NEH6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM247A6NEH6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TMEM247A6NEH6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TMEM247A6NEH6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TMEM247A6NEH6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TMEM247A6NEH6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM247A6NEH6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM247A6NEH6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TMEM247A6NEH6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM247A6NEH6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM247A6NEH6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
TMEM247A6NEH6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM247A6NEH6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TMEM247A6NEH6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM247A6NEH6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TMEM247A6NEH6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TMEM247A6NEH6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM247A6NEH6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM247A6NEH6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM247A6NEH6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TMEM247A6NEH6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms