Protein–RNA interactions for Protein: A6NCS4

NKX2-6, Homeobox protein Nkx-2.6, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-6A6NCS4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NKX2-6A6NCS4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX2-6A6NCS4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NKX2-6A6NCS4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NKX2-6A6NCS4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX2-6A6NCS4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX2-6A6NCS4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NKX2-6A6NCS4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX2-6A6NCS4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX2-6A6NCS4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX2-6A6NCS4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NKX2-6A6NCS4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NKX2-6A6NCS4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NKX2-6A6NCS4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NKX2-6A6NCS4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NKX2-6A6NCS4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX2-6A6NCS4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NKX2-6A6NCS4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX2-6A6NCS4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NKX2-6A6NCS4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX2-6A6NCS4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NKX2-6A6NCS4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX2-6A6NCS4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NKX2-6A6NCS4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX2-6A6NCS4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX2-6A6NCS4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
NKX2-6A6NCS4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX2-6A6NCS4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX2-6A6NCS4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX2-6A6NCS4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NKX2-6A6NCS4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX2-6A6NCS4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NKX2-6A6NCS4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NKX2-6A6NCS4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NKX2-6A6NCS4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NKX2-6A6NCS4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NKX2-6A6NCS4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKX2-6A6NCS4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NKX2-6A6NCS4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NKX2-6A6NCS4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX2-6A6NCS4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX2-6A6NCS4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX2-6A6NCS4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NKX2-6A6NCS4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NKX2-6A6NCS4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NKX2-6A6NCS4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX2-6A6NCS4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NKX2-6A6NCS4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX2-6A6NCS4 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NKX2-6A6NCS4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX2-6A6NCS4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX2-6A6NCS4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NKX2-6A6NCS4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX2-6A6NCS4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NKX2-6A6NCS4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX2-6A6NCS4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NKX2-6A6NCS4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NKX2-6A6NCS4 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NKX2-6A6NCS4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKX2-6A6NCS4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NKX2-6A6NCS4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NKX2-6A6NCS4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKX2-6A6NCS4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX2-6A6NCS4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKX2-6A6NCS4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX2-6A6NCS4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX2-6A6NCS4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKX2-6A6NCS4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NKX2-6A6NCS4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NKX2-6A6NCS4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX2-6A6NCS4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX2-6A6NCS4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKX2-6A6NCS4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX2-6A6NCS4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX2-6A6NCS4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKX2-6A6NCS4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX2-6A6NCS4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX2-6A6NCS4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKX2-6A6NCS4 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX2-6A6NCS4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX2-6A6NCS4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKX2-6A6NCS4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX2-6A6NCS4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKX2-6A6NCS4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX2-6A6NCS4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKX2-6A6NCS4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NKX2-6A6NCS4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKX2-6A6NCS4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX2-6A6NCS4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKX2-6A6NCS4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX2-6A6NCS4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NKX2-6A6NCS4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX2-6A6NCS4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX2-6A6NCS4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKX2-6A6NCS4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX2-6A6NCS4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX2-6A6NCS4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX2-6A6NCS4 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKX2-6A6NCS4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKX2-6A6NCS4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms