Protein–RNA interactions for Protein: A5PL33

KRBA1, Protein KRBA1, humanhuman

Predictions only

Length 1,030 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRBA1A5PL33 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRBA1A5PL33 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRBA1A5PL33 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRBA1A5PL33 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRBA1A5PL33 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRBA1A5PL33 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRBA1A5PL33 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
KRBA1A5PL33 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRBA1A5PL33 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRBA1A5PL33 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRBA1A5PL33 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
KRBA1A5PL33 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRBA1A5PL33 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRBA1A5PL33 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KRBA1A5PL33 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KRBA1A5PL33 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29■■■□□ 2.23
KRBA1A5PL33 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KRBA1A5PL33 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRBA1A5PL33 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRBA1A5PL33 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRBA1A5PL33 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRBA1A5PL33 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRBA1A5PL33 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRBA1A5PL33 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRBA1A5PL33 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
KRBA1A5PL33 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
KRBA1A5PL33 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRBA1A5PL33 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRBA1A5PL33 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRBA1A5PL33 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KRBA1A5PL33 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRBA1A5PL33 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRBA1A5PL33 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
KRBA1A5PL33 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRBA1A5PL33 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRBA1A5PL33 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KRBA1A5PL33 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRBA1A5PL33 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRBA1A5PL33 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KRBA1A5PL33 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRBA1A5PL33 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRBA1A5PL33 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRBA1A5PL33 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRBA1A5PL33 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRBA1A5PL33 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRBA1A5PL33 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KRBA1A5PL33 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRBA1A5PL33 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
KRBA1A5PL33 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRBA1A5PL33 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRBA1A5PL33 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRBA1A5PL33 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRBA1A5PL33 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRBA1A5PL33 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRBA1A5PL33 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
KRBA1A5PL33 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRBA1A5PL33 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
KRBA1A5PL33 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRBA1A5PL33 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
KRBA1A5PL33 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRBA1A5PL33 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRBA1A5PL33 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRBA1A5PL33 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRBA1A5PL33 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRBA1A5PL33 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRBA1A5PL33 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
KRBA1A5PL33 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRBA1A5PL33 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRBA1A5PL33 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRBA1A5PL33 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KRBA1A5PL33 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRBA1A5PL33 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRBA1A5PL33 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KRBA1A5PL33 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRBA1A5PL33 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
KRBA1A5PL33 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRBA1A5PL33 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRBA1A5PL33 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRBA1A5PL33 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRBA1A5PL33 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRBA1A5PL33 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRBA1A5PL33 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRBA1A5PL33 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRBA1A5PL33 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRBA1A5PL33 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRBA1A5PL33 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRBA1A5PL33 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRBA1A5PL33 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRBA1A5PL33 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRBA1A5PL33 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRBA1A5PL33 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRBA1A5PL33 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRBA1A5PL33 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRBA1A5PL33 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRBA1A5PL33 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRBA1A5PL33 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRBA1A5PL33 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRBA1A5PL33 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRBA1A5PL33 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRBA1A5PL33 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms